RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACRBPQ8NEB7 543 aa34.17■■■■□ 3.06
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PROSCO94903 275 aa34.16■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGEA9P43362 315 aa34.16■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDH18Q13634 790 aa34.16■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CARNMT1Q8N4J0 409 aa34.16■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC26Q8TAB7 109 aa34.16■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 FIBINQ8TAL6 211 aa34.16■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 PEBP4Q96S96 227 aa34.16■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa34.16■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 DOCK4Q8N1I0 1966 aa34.16■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 DRGXA6NNA5 263 aa34.15■■■■□ 3.06
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP25P42331 645 aa34.15■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERMARDQ5T6L9 678 aa34.15■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa34.15■■■■□ 3.06
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LRFN3Q9BTN0 628 aa34.15■■■■□ 3.06
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP6O43182 974 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 HLA-FP30511 346 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFRSF4P43489 277 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHST9Q7L1S5 443 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa34.14■■■■□ 3.06
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CTDNEP1-209ENST00000574205 AP4E1Q9UPM8 1137 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATG2BQ96BY7 2078 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLDN11O75508 207 aa34.14■■■■□ 3.06
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CTDNEP1-209ENST00000574205 L1CAMP32004 1257 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAN1A1P33908 653 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 VAV2P52735 878 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDH4P55283 916 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARTNQ5T4W7 220 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 MANEALQ5VSG8 457 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SFTPA1Q8IWL2 248 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRDQ9H2X0 955 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 TFR2Q9UP52 801 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRDCO43847 1150 aa34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 IRAK1P51617 712 aa34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 HADHBP55084 474 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCB8Q9NUT2 735 aa34.13■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF40O75150 1001 aa34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRIG2O94898 1065 aa34.12■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM72AQ5TYM5 149 aa34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM72DQ6L9T8 149 aa34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM72BQ86X60 149 aa34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 PYROXD2Q8N2H3 581 aa34.12■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DESI2Q9BSY9 194 aa34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 IER2Q9BTL4 223 aa34.12■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MPP6Q9NZW5 540 aa34.11■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTNL10A8MVZ5 291 aa34.09■■■■□ 3.05
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