RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 GNSP15586 552 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 DEFB106AQ8N104 65 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 DNASE2BQ8WZ79 361 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 TTC17Q96AE7 1141 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SLC2A13Q96QE2 648 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 DACH1Q9UI36 760 aa23.51■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 H0Y626 953 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 PES1O00541 588 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 OPHN1O60890 802 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 ERBB2P04626 1255 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SYPP08247 313 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 KRT9P35527 623 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 RPS14P62263 151 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 CDK17Q00537 523 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 PITRM1Q5JRX3 1037 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 OR6B2Q6IFH4 312 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 HDDC3Q8N4P3 179 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 NOX5Q96PH1 765 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 FBRSQ9HAH7 460 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 DDIT4Q9NX09 232 aa23.5■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 METTL12A8MUP2 240 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 KCNU1A8MYU2 1149 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 HSF2BPO75031 334 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 ASLP04424 464 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 GLI1P08151 1106 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 ACSL1P33121 698 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 NUMBP49757 651 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 ST8SIA6P61647 398 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SHC2P98077 582 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SEMA3BQ13214 749 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 RAPGEF1Q13905 1077 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 KCNJ12Q14500 433 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 PTPN20Q4JDL3 420 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 EFHC1Q5JVL4 640 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 OLFML1Q6UWY5 402 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 PIP4P1Q86T03 277 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 MRGPRX3Q96LB0 322 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SUN2Q9UH99 717 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 FHOD1Q9Y613 1164 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 DOCK4Q8N1I0 1966 aa23.49■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 A0A1B0GTW7 788 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 F5H5T6 163 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 DNTTP04053 509 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 KCNMA1Q12791 1236 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 FOXC1Q12948 553 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 GRIK2Q13002 908 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 FAM71AQ8IYT1 594 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SNX19Q92543 992 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 RNF34Q969K3 372 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SLC32A1Q9H598 525 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SYNCQ9H7C4 482 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 LMBRD1Q9NUN5 540 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa23.48■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 FAM170AA1A519 330 aa23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SIN3BO75182 1162 aa23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 DAB1O75553 588 aa23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 C7P10643 843 aa23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 ABCB4P21439 1286 aa23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 APCDD1Q8J025 514 aa23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 ERVW-1Q9UQF0 538 aa23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 CEP83Q9Y592 693 aa23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa23.47■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 UPK3BL1B0FP48 263 aa23.46■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 UPK3BL2E5RIL1 263 aa23.46■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 MOCS3O95396 460 aa23.46■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SLC2A3P11169 496 aa23.46■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 CCR1P32246 355 aa23.46■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SLC6A3Q01959 620 aa23.46■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 ZBTB16Q05516 673 aa23.46■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 NME3Q13232 169 aa23.46■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa23.46■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SMYD5Q6GMV2 418 aa23.46■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 SLC26A9Q7LBE3 791 aa23.46■■□□□ 1.35
PPP4C-212ENST00000567828 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
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