RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 PIP5K1AQ99755 562 aa5.69□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 CLDN16Q9Y5I7 305 aa5.69□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa5.69□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 E9PBE3 544 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 FOXP2O15409 715 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 CBR3O75828 277 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 TOMM70O94826 608 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 F13BP05160 661 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 RALAP11233 206 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 CHN1P15882 459 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 TKTP29401 623 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 MAPK4P31152 587 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 CIITAP33076 1130 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 THPOP40225 353 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PIK3CBP42338 1070 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 RABIFP47224 123 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 STARP49675 285 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 RAC3P60763 192 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 ERVK-21P61565 698 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 HTRA3P83110 453 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 ENPEPQ07075 957 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 LGALS3BPQ08380 585 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 SMARCB1Q12824 385 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 RAPSNQ13702 412 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 ACVR2BQ13705 512 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 KCNC3Q14003 757 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PLS1Q14651 629 aa5.68□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 UBE3CQ15386 1083 aa5.68□□□□□ -1.5
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