RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLIN3O60664 434 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 PSMG1O95456 288 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 FYNP06241 537 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDHA1P08559 390 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 NOS2P35228 1153 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 GLUD2P49448 558 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCLAFQ15004 111 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 SV2CQ496J9 727 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 C10orf107Q8IVU9 208 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDKL2Q92772 493 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 NT5C3BQ969T7 300 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 MED10Q9BTT4 135 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZFATQ9P243 1243 aa20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 TKTL1P51854 596 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 DPYSQ14117 519 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYS1Q717R9 158 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 SUFUQ9UMX1 484 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNE1P15382 129 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 CNTFP26441 200 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC1A6P48664 564 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDK1Q15118 436 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 MUM1Q2TAK8 710 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 HACE1Q8IYU2 909 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNAJC9Q8WXX5 260 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNK16Q96T55 309 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 BATF3Q9NR55 127 aa20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTGESO14684 152 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 DCLK1O15075 740 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERCC2P18074 760 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 PNPLA4P41247 253 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 CACNA2D1P54289 1103 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 MFSD10Q14728 455 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANO7Q6IWH7 933 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAVSQ7Z434 540 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 BNIPLQ7Z465 357 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 WNT8BQ93098 351 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 THTPAQ9BU02 230 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT82Q9NSB4 513 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 PNPOQ9NVS9 261 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 STOML1Q9UBI4 398 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 TAGLN3Q9UI15 199 aa20.5■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 GLRA3O75311 464 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATP6V1C1P21283 382 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 BEX3Q00994 111 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 TUBB3Q13509 450 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 BLMHQ13867 455 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 XKR4Q5GH76 650 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 TNS4Q8IZW8 715 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 NPWQ8N729 165 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 AGAP2Q99490 1192 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 APOL2Q9BQE5 337 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 TYK2P29597 1187 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 RSPH3Q86UC2 560 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 POU5F2Q8N7G0 328 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 CERS2Q96G23 380 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.49■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 NVLO15381 856 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
AFG3L1P-217ENST00000557444 SERPINA6P08185 405 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms