RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.71□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CYP2W1Q8TAV3 490 aa5.71□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 RSPRY1Q96DX4 576 aa5.71□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 FLRT1Q9NZU1 646 aa5.71□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 COL20A1Q9P218 1284 aa5.71□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CACNA1BQ00975 2339 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 TISP43B9A030 160 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SRGAP2O75044 1071 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CETPP11597 493 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 KLRC1P26715 233 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 PEX2P28328 305 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 MMP14P50281 582 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 ITGA8P53708 1063 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 FAM193AP78312 1265 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 E2F1Q01094 437 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CYP1B1Q16678 543 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 TRIM72Q6ZMU5 477 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SESTD1Q86VW0 696 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 TERB1Q8NA31 727 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SLC29A3Q9BZD2 475 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 MIS18AQ9NYP9 233 aa5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 PKD1L2Q7Z442 2459 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 RAB27BO00194 218 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CYP2D6P10635 497 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 UQCRC1P31930 480 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 ARHGEF7Q14155 803 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SLC29A2Q14542 456 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 DLGAP5Q15398 846 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 MCM10Q7L590 875 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 MORC1Q86VD1 984 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CHSY1Q86X52 802 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 PRR25Q96S07 402 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CIPCQ9C0C6 399 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CHST8Q9H2A9 424 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 AMFRQ9UKV5 643 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SH3TC1Q8TE82 1336 aa5.69□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 PDHXO00330 501 aa5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CES2O00748 559 aa5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CCP110O43303 1012 aa5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 PMPCBO75439 489 aa5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 LATS1O95835 1130 aa5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 EPHA3P29320 983 aa5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 MPGP29372 298 aa5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 GKP32189 559 aa5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 DCTN1Q14203 1278 aa5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 FCRL6Q6DN72 434 aa5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 UNC13DQ70J99 1090 aa5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 WDR91A4D1P6 747 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 FGAP02671 866 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 TXNP10599 105 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 HGFP14210 728 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 RHCEP18577 417 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 FPR3P25089 353 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 GATMP50440 423 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 RPS8P62241 208 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 RHDQ02161 417 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SEMA5AQ13591 1074 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 GALEQ14376 348 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 CEP78Q5JTW2 689 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 YAF2Q8IY57 180 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SNX18Q96RF0 628 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.67□□□□□ -1.5
ATXN3-218ENST00000553309 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms