RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552548.5

PFDN5-217, Transcript of prefoldin subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene PFDN5, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5-217ENST00000552548 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ACOX2Q99424 681 aa7.3□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.3□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 CALN1Q9BXU9 219 aa7.3□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 CEP41Q9BYV8 373 aa7.3□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 SLC39A8Q9C0K1 460 aa7.3□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 TRPV4Q9HBA0 871 aa7.3□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.3□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 THEGQ9P2T0 379 aa7.3□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 MUTYHQ9UIF7 546 aa7.3□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 AMFRQ9UKV5 643 aa7.3□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ESPNB1AK53 854 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 WASH3PC4AMC7 463 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 PRRT4C9JH25 899 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 J3KR12 359 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 DCLK1O15075 740 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ZSCAN12O43309 604 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 CEP104O60308 925 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 RNF8O76064 485 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 CD160O95971 181 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 MT-CO1P00395 513 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 CISD3P0C7P0 127 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 VAV1P15498 845 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 HLA-FP30511 346 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 GBP1P32455 592 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 CSKP41240 450 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 WASP42768 502 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 KCNJ1P48048 391 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 PPP3CCP48454 512 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 STK19P49842 368 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 TERF1P54274 439 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 COG7P83436 770 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 SCAPQ12770 1279 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 LMAN2Q12907 356 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 SNX1Q13596 522 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 KRT81Q14533 505 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 PTPRRQ15256 657 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 RPS6KA1Q15418 735 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 DPYSL2Q16555 572 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 TAZQ16635 292 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ANO4Q32M45 955 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ADGRF1Q5T601 910 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 TTC27Q6P3X3 843 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 RFX8Q6ZV50 586 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 RFX6Q8HWS3 928 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 MFSD6LQ8IWD5 586 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 LEMD2Q8NC56 503 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 KCTD6Q8NC69 237 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 USP33Q8TEY7 942 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 OSCP1Q8WVF1 389 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 IRF7Q92985 503 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 NTAN1Q96AB6 310 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ELSPBP1Q96BH3 223 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ALG14Q96F25 216 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 HMCESQ96FZ2 354 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 BTN2A3PQ96KV6 586 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ASB2Q96Q27 587 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 SMIM14Q96QK8 99 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 OSBPL9Q96SU4 736 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 TSGA10Q9BZW7 698 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 EPC1Q9H2F5 836 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ECT2Q9H8V3 914 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 SPHK2Q9NRA0 654 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 GDE1Q9NZC3 331 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 DPP7Q9UHL4 492 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 STOML2Q9UJZ1 356 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 CA14Q9ULX7 337 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 COL4A2P08572 1712 aa7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa7.28□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 E2F8A0AVK6 867 aa7.28□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 KRBA1A5PL33 1030 aa7.28□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 MUSKO15146 869 aa7.28□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 KIF5CO60282 957 aa7.28□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 CST8O60676 142 aa7.28□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ECI2O75521 394 aa7.28□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 EGFP01133 1207 aa7.28□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 PENKP01210 267 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 APOEP02649 317 aa7.28□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.28□□□□□ -1.24
PFDN5-217ENST00000552548 TYRP14679 529 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms