RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	NCAPH	Q15003	741 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	IL31	Q6EBC2	164 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	ERICH1	Q86X53	443 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	LGI2	Q8N0V4	545 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	C18orf8	Q96DM3	657 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	EDEM2	Q9BV94	578 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	VPS16	Q9H269	839 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	DDIT4	Q9NX09	232 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	KNL1	Q8NG31	2342 aa		11.88	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	LGALS16	A8MUM7	142 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	PATE3	B3GLJ2	98 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137		F5H5T6	163 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	F9	P00740	461 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	SERPINF2	P08697	491 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	ABCB4	P21439	1286 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	ITPKA	P23677	461 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	CXCR3	P49682	368 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	OXCT1	P55809	520 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	CDR2	Q01850	454 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	CDH18	Q13634	790 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	FSCB	Q5H9T9	825 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	BNIPL	Q7Z465	357 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	CHSY1	Q86X52	802 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	XYLT1	Q86Y38	959 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	NUP58	Q9BVL2	599 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	CAPN10	Q9HC96	672 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	CD93	Q9NPY3	652 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	STIM2	Q9P246	746 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137		A0A1B0GVM2	712 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	C4orf47	A7E2U8	309 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	METTL12	A8MUP2	240 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137		M0QYT0	321 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	EPHB6	O15197	1021 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	NDUFS2	O75306	463 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	GRAP2	O75791	330 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	MOCS3	O95396	460 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	HLA-E	P13747	358 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	MMP8	P22894	467 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	SOX5	P35711	763 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	CSK	P41240	450 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	NOMO3	P69849	1222 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	SULT2A1	Q06520	285 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	FBXL22	Q6P050	247 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CS-223	ENST00000551137	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		11.86	□□□□□ -0.51

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