RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TTLL8A6PVC2 850 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM177BA6PVY3 158 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 E9PI62 339 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SYT5O00445 386 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MEIS2O14770 477 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CLDN3O15551 220 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 B3GALT2O43825 422 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TLR2O60603 784 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRAMEF12O95522 483 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FYNP06241 537 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NFICP08651 508 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RARBP10826 455 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EZRP15311 586 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ATF6P18850 670 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PCSK1P29120 753 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CABP4P57796 275 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRKCEQ02156 737 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CYP27A1Q02318 531 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PTSQ03393 145 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LIPEQ05469 1076 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RING1Q06587 406 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ENPEPQ07075 957 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LMAN2Q12907 356 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DUSP4Q13115 394 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MPEG1Q2M385 716 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF805Q5CZA5 627 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAXCQ5TGI0 409 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CACHD1Q5VU97 1274 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPRYD7Q5W111 196 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM171BQ6P995 826 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NPNTQ6UXI9 565 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM217AQ8IXS0 508 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC13A3Q8WWT9 602 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PHF21BQ96EK2 531 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ALG14Q96F25 216 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SIPA1Q96FS4 1042 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MYRFLQ96LU7 910 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PIP5K1AQ99755 562 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC26A1Q9H2B4 701 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IKZF4Q9H2S9 585 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGFLR1Q9H665 355 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMOD3Q9NYL9 352 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SERPINB13Q9UIV8 391 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 APPL1Q9UKG1 709 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CSADQ9Y600 493 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SOGA1O94964 1423 aa7.33□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FRMPD4Q14CM0 1322 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1W2PPE2 198 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1W2PR64 198 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SNTNA6NMZ2 147 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AHRRA9YTQ3 701 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CTAG2O75638 210 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MYO1DO94832 1006 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UBXN7O94888 489 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SCG5P05408 212 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TPOP07202 933 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZCCHC18P0CG32 403 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SELLP14151 372 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 M6PRP20645 277 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPTP24298 496 aa7.32□□□□□ -1.24
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARL3P36405 182 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms