RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 SPHK2Q9NRA0 654 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 DONSONQ9NYP3 566 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 MARK1Q9P0L2 795 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 SRGAP2O75044 1071 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 EPHB2P29323 1055 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 DNA2P51530 1060 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 MPPE1Q53F39 396 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 IRF7Q92985 503 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 IGSF8Q969P0 613 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 MYEOVQ96EZ4 313 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF157Q96PX1 679 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ZYG11BQ9C0D3 744 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNK12Q9HB15 430 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 STIM2Q9P246 746 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 WASH4PA8MWX3 477 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 NFATC1O95644 943 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 RHOQP17081 205 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 AMPD2Q01433 879 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 CHST9Q7L1S5 443 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 YAF2Q8IY57 180 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 A0A1B0GVM2 712 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 TCAF2A6NFQ2 919 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ARNTLO00327 626 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 RPS24P62847 133 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 MMRN1Q13201 1228 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 NLRP14Q86W24 1093 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM25Q86YD3 366 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 PSMB7Q99436 277 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF212Q9UDV6 495 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 CLDN11O75508 207 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ADH1CP00326 375 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 CYBBP04839 570 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 CDH4P55283 916 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 DHCR24Q15392 516 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 FYB2Q5VWT5 728 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 MPP6Q9NZW5 540 aa22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 DOCK4Q8N1I0 1966 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 DCLK1O15075 740 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 DAPK3O43293 454 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP17A1P05093 508 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ERCC2P18074 760 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 CXCR5P32302 372 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 SGSHP51688 502 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ZP2Q05996 745 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 TFDP2Q14188 446 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 GRM2Q14416 872 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 PQLC3Q8N755 202 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 KIF18AQ8NI77 898 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 P2RY11Q96G91 374 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 HPS4Q9NQG7 708 aa22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 TSPAN3O60637 253 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 GDI1P31150 447 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 IRAK1P51617 712 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ALFQ53S48 1182 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 TPGS1Q6ZTW0 290 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 BBS12Q6ZW61 710 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 CFAP52Q8N1V2 620 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 DDI1Q8WTU0 396 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 EBF3Q9H4W6 596 aa22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3-205ENST00000528462 ECT2Q9H8V3 914 aa22.65■■□□□ 1.22
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