RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522907.5

MSRA-208, Transcript of methionine sulfoxide reductase A, humanhuman

TSL 5

Gene MSRA, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRA-208ENST00000522907 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 MIA3Q5JRA6 1907 aa5.66□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 A0A1W2PP55 124 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 FAM170AA1A519 330 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 I6L893 689 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ZNF197O14709 1029 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 MDM4O15151 490 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ECI2O75521 394 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 FBXO21O94952 628 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 LCA5LO95447 670 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 GJB6O95452 261 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 LTFP02788 710 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 KLKB1P03952 638 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 SERPING1P05155 500 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 TPM3P06753 285 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ASGR2P07307 311 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 GZMAP12544 262 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 PFKLP17858 780 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 SP100P23497 879 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 MAPK1P28482 360 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 VIPR2P41587 438 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ACADSBP45954 432 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 PPP3CCP48454 512 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 KLHL30Q0D2K2 578 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 FCHO2Q0JRZ9 810 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ZNF77Q15935 545 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ASIC2Q16515 512 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 GAB4Q2WGN9 574 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 RAB6CQ53S08 254 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 GPR158Q5T848 1215 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 CYP4A22Q5TCH4 519 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 SYPL2Q5VXT5 272 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 BSPRYQ5W0U4 402 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 RNF43Q68DV7 783 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 VITQ6UXI7 678 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 TRIM72Q6ZMU5 477 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ACAD11Q709F0 780 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ARCQ7LC44 396 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 MAB21L3Q8N8X9 362 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 TMEM35BQ8NCS4 154 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 CPLX3Q8WVH0 158 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 KLHDC7BQ96G42 594 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 PDLIM2Q96JY6 352 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 SLITRK1Q96PX8 696 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 PANX2Q96RD6 677 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 RAB6CQ9H0N0 254 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ISCUQ9H1K1 167 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 SMOC2Q9H3U7 446 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 GRPEL1Q9HAV7 217 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 KCNK12Q9HB15 430 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 PIDD1Q9HB75 910 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 NPHS2Q9NP85 383 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ASNSD1Q9NWL6 643 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 OBP2AQ9NY56 170 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa5.65□□□□□ -1.5
MSRA-208ENST00000522907 CACNA1HO95180 2353 aa5.65□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 METTL12A8MUP2 240 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 TLR5O60602 858 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 DAB1O75553 588 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 GLI1P08151 1106 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 RARGP13631 454 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 LCP1P13796 627 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 FLT3P36888 993 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 SLC6A3Q01959 620 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 OGDHQ02218 1023 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 HECTD3Q5T447 861 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 ACAD10Q6JQN1 1059 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 VN1R5Q7Z5H4 357 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 CCNJLQ8IV13 435 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 CNGA4Q8IV77 575 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 FMNL3Q8IVF7 1028 aa5.64□□□□□ -1.51
MSRA-208ENST00000522907 FAM217AQ8IXS0 508 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms