RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 MFN1Q8IWA4 741 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CHPFQ8IZ52 775 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CARNMT1Q8N4J0 409 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 IL17RCQ8NAC3 791 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 TSTD1Q8NFU3 115 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 NT5C3BQ969T7 300 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 P2RY11Q96G91 374 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 VCPIP1Q96JH7 1222 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SYT11Q9BT88 431 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 TRIM5Q9C035 493 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CIPCQ9C0C6 399 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 TKTL2Q9H0I9 626 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CLEC4EQ9ULY5 219 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 STARD13Q9Y3M8 1113 aa15.97■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ACACBO00763 2458 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SIGLEC16A6NMB1 481 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 H0Y626 953 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 PAGE1O75459 146 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ALDH1A2O94788 518 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 EPN2O95208 641 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 GJB6O95452 261 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 APBB3O95704 486 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 GZMAP12544 262 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 GPD1P21695 349 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 NTSR1P30989 418 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CXCR3P49682 368 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 DGKEP52429 567 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 RPS24P62847 133 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 GEN1Q17RS7 908 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CFAP52Q8N1V2 620 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 JOSD2Q8TAC2 188 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 TRIM11Q96F44 468 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 LOXL4Q96JB6 756 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SIK2Q9H0K1 926 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SMOC1Q9H4F8 434 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ABCB8Q9NUT2 735 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 TAS2R14Q9NYV8 317 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 GGA2Q9UJY4 613 aa15.96■□□□□ 0.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ANTXRLA6NF34 631 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 C2CD4BA6NLJ0 364 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 SGK1O00141 431 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 NPC1O15118 1278 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 TIMM44O43615 452 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 RTN2O75298 545 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF806P0C7X5 589 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 RRM1P23921 792 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 HLA-FP30511 346 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 WASP42768 502 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 PTPN9P43378 593 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 CRY1Q16526 586 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 ARL13BQ3SXY8 428 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 TRNP1Q6NT89 227 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 LRRC31Q6UY01 552 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 CHST9Q7L1S5 443 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM131BQ86XD5 332 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 VSTM4Q8IW00 320 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 AHI1Q8N157 1196 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 MCEEQ96PE7 176 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 PARVAQ9NVD7 372 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 ELOVL2Q9NXB9 296 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 HS3ST4Q9Y661 456 aa15.95■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 SDK1Q7Z5N4 2213 aa15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 DCLK1O15075 740 aa15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 KRT37O76014 449 aa15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 MOCS3O95396 460 aa15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 ADCY5O95622 1261 aa15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 FTLP02792 175 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 HOXB2P14652 356 aa15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 MPLP40238 635 aa15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 AUHQ13825 339 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 ELF2Q15723 593 aa15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC14Q49A88 953 aa15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 HGSNATQ68CP4 663 aa15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 FBXL22Q6P050 247 aa15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 WDR59Q6PJI9 974 aa15.94■□□□□ 0.14
TSNARE1-206ENST00000520462 SARM1Q6SZW1 724 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms