RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM175Q9BSA9 504 aa18■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 CXCL10P02778 98 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 INHBAP08476 426 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 DRD4P21917 467 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 TLE2Q04725 743 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 GALNT2Q10471 571 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 GPR17Q13304 367 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 PPP2R5DQ14738 602 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 TAS1R1Q7RTX1 841 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 CTAGE3PQ8IX95 158 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRC34Q8IZ02 419 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 GMIPQ9P107 970 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 IGSF9Q9P2J2 1179 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 KRT4P19013 534 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 YWHAQP27348 245 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRC8BQ6P9F7 803 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 UNC5AQ6ZN44 842 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 AGAP3Q96P47 875 aa17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 MTMR11A4FU01 709 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 H7C4K7 107 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 PARNO95453 639 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 APOEP02649 317 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 MLNP12872 115 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 TRIM60Q495X7 471 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 CASC4Q6P4E1 433 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 ANKS3Q6ZW76 656 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRC43Q8N309 656 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 PPM1NQ8N819 430 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 SPPL2BQ8TCT7 592 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC44A1Q8WWI5 657 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 SGSM3Q96HU1 749 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 TTPALQ9BTX7 342 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 TTLL3Q9Y4R7 772 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 22.4
TSNARE1-204ENST00000519651 MTSS1O43312 755 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 DUSP4Q13115 394 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 CKAP2Q8WWK9 683 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 FBXO32Q969P5 355 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 CRISPLD1Q9H336 500 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 PLAC1Q9HBJ0 212 aa17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 VWA8A3KMH1 1905 aa17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 SDR42E2A6NKP2 422 aa17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 KCNU1A8MYU2 1149 aa17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 DFFAO00273 331 aa17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 GSTA2P09210 222 aa17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 CA4P22748 312 aa17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 TEX44Q53QW1 395 aa17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRC6Q86X45 466 aa17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 GSDMBQ8TAX9 411 aa17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 TBC1D31Q96DN5 1066 aa17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 SEC16BQ96JE7 1060 aa17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 IL37Q9NZH6 218 aa17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 TLR6Q9Y2C9 796 aa17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 HS3ST4Q9Y661 456 aa17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 PATJQ8NI35 1801 aa17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 WDR27A2RRH5 827 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 TCP11X1B4DZS4 312 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 TBC1D4O60343 1298 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 PRKCHP24723 683 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 TUBP50607 506 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 CRADDP78560 199 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 EFEMP1Q12805 493 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 TAF10Q12962 218 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 SPARCL1Q14515 664 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 MICALCLQ6ZW33 695 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC26A11Q86WA9 606 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 MZB1Q8WU39 189 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 NEU3Q9UQ49 428 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 CDY1Q9Y6F8 540 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 SCN5AQ14524 2016 aa17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1-204ENST00000519651 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms