RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516564.1

RNU6-358P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 358, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-358P, Length 75 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-358P-201ENST00000516564 GOLGA6BA6NDN3 693 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 OR6C75A6NL08 312 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 NPC1O15118 1278 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 KPNA5O15131 536 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 CAMTA2O94983 1202 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 NDST3O95803 873 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 VIPP01282 170 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 CYP1A2P05177 515 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 GOLGA6DP0CG33 693 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 SRGAP2BP0DMP2 458 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 TGM2P21980 687 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 CBFBQ13951 182 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 GFOD2Q3B7J2 385 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 RTL10Q7L3V2 364 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 C14orf80Q86SX3 495 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 CCDC33Q8N5R6 958 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 RNF152Q8N8N0 203 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 JDP2Q8WYK2 163 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 NR4A3Q92570 626 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 NPIPB3Q92617 1050 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 PHF21BQ96EK2 531 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 SNX27Q96L92 541 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 NUDT22Q9BRQ3 303 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 DCLK3Q9C098 648 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 MAGEH1Q9H213 219 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 RMI1Q9H9A7 625 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 IL21RQ9HBE5 538 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 PLAC1Q9HBJ0 212 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 CXorf65A6NEN9 183 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 RGS14O43566 566 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 KLKB1P03952 638 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 GABRB3P28472 473 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 GAS1P54826 345 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 SHC2P98077 582 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 TRAF1Q13077 416 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 SLC5A9Q2M3M2 681 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 BEND5Q7L4P6 421 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZNF329Q86UD4 541 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 EXD3Q8N9H8 876 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 TTC8Q8TAM2 541 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 PRDM11Q9NQV5 511 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 MYO1AQ9UBC5 1043 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 LMTK3Q96Q04 1460 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 DHHO43323 396 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 GRID2O43424 1007 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 NEURL1O76050 574 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 PEPDP12955 493 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 IDEP14735 1019 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 TSHRP16473 764 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 EGR1P18146 543 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 COMPP49747 757 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 PDLIM4P50479 330 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 ABATP80404 500 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 Q0VFX4 171 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 PMPCAQ10713 525 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 GPS2Q13227 327 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 GPR18Q14330 331 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 PRSS57Q6UWY2 283 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 KDELC2Q7Z4H8 507 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 TMPRSS12Q86WS5 348 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 TIFAQ96CG3 184 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 TM6SF1Q9BZW5 370 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 CDT1Q9H211 546 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 A0A1W2PPC4 97 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 CLEC18AA5D8T8 446 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 GAGE12JA6NER3 117 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 J3KTA2 159 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 SPRY3O43610 288 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 TAF5LO75529 589 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZNF432O94892 652 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 LCATP04180 440 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 ITGA5P08648 1049 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-358P-201ENST00000516564 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms