RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 UGP2Q16851 508 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAAP20Q6NZ36 180 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 C19orf48Q6RUI8 117 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 Q6ZSV7 163 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 CYB5R4Q7L1T6 521 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 RHPN2Q8IUC4 686 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF440Q8IYI8 595 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 CHPFQ8IZ52 775 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 DEPTORQ8TB45 409 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 SECTM1Q8WVN6 248 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 LGALS12Q96DT0 336 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 CYYR1Q96J86 154 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 LINC00479Q96M42 142 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRIM2Q9C040 744 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZFP57Q9NU63 452 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 ABHD10Q9NUJ1 306 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 LMBRD1Q9NUN5 540 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 VPS4AQ9UN37 437 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC8A2Q9UPR5 921 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLAAQ9Y263 795 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 KCNK7Q9Y2U2 307 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 RNF213Q63HN8 5207 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A087WWL8 130 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A0J9YWU9 116 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 KLLNB2CW77 178 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 H3BUI4 141 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 SNX2O60749 519 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 SRGAP2O75044 1071 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 RASAL1O95294 804 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 NFATC1O95644 943 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 PRSS1P07477 247 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM225BP0DP42 221 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 CETPP11597 493 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 NAGAP17050 411 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 CHRNB2P17787 502 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAE1P78406 368 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 DLK1P80370 383 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 SREBF2Q12772 1141 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 LRMPQ12912 555 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 MYBPHQ13203 477 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 GAB1Q13480 694 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 HNF4GQ14541 408 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 INSCQ1MX18 579 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 UAP1L1Q3KQV9 507 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 TKFCQ3LXA3 575 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF343Q6P1L6 599 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 PGM2L1Q6PCE3 622 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 METTL7BQ6UX53 244 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 KDELC2Q7Z4H8 507 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 ADIPOR2Q86V24 386 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 ERC1Q8IUD2 1116 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 P3H2Q8IVL5 708 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC34A3Q8N130 599 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 FGFRL1Q8N441 504 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 METTL25Q8N6Q8 603 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 C11orf44Q8N8P7 122 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF114Q8NC26 417 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 FGFBP3Q8TAT2 258 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 BICD2Q8TD16 824 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZFPM2Q8WW38 1151 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 APPBP2Q92624 585 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 LCE3DQ9BYE3 92 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 SAP30LQ9HAJ7 183 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 TXNRD2Q9NNW7 524 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 GABBR1Q9UBS5 961 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 CPA4Q9UI42 421 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-287P-201ENST00000516230 PCDHA6Q9UN73 950 aa0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms