RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBR7	Q8N806	425 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	HAS1	Q92839	578 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	NPHS2	Q9NP85	383 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ACP6	Q9NPH0	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZBTB14	O43829	449 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBE4B	O95155	1302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	NDST3	O95803	873 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC9A1	P19634	815 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	GPD2	P43304	727 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ASIC2	Q16515	512 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MSS51	Q4VC12	460 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ILDR2	Q71H61	639 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	KY	Q8NBH2	561 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	UCK1	Q9HA47	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLLP	Q9Y342	182 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	LINC01387	J3KSC0	135 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MCF2L	O15068	1137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZW10	O43264	779 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SPAG7	O75391	227 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TADA2A	O75478	443 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SPN	P16150	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	DNAJB2	P25686	324 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CD40LG	P29965	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	RFC4	P35249	363 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	TGFBR2	P37173	567 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CABP4	P57796	275 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	GPLD1	P80108	840 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	S100A12	P80511	92 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	COASY	Q13057	564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	GRM4	Q14833	912 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	SBK1	Q52WX2	424 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SLC38A9-222	ENST00000515159	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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