RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 LRRC71Q8N4P6 559 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 ETNPPLQ8TBG4 499 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 TBCKQ8TEA7 893 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 PHKBQ93100 1093 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 SCLT1Q96NL6 688 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 DNM3Q9UQ16 869 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 HIDE1A8MVS5 230 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 PER2O15055 1255 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 TBX3O15119 743 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 ENDOD1O94919 500 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 CSPG5O95196 566 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 C1RP00736 705 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 SELENOPP49908 381 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 EPHB1P54762 984 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 NLRP5P59047 1200 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 HHEXQ03014 270 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 NOMO1Q15155 1222 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 UGCGQ16739 394 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 PPP4R3AQ6IN85 833 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 Q6ZSN1 163 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 Q6ZVL8 140 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 RUFY3Q7L099 469 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 PRSS33Q8NF86 280 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 OR7D4Q8NG98 312 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 RIPOR3Q96MK2 946 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 SLC26A6Q9BXS9 759 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 TM6SF1Q9BZW5 370 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 ZBP1Q9H171 429 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 UNC45AQ9H3U1 944 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 DEF6Q9H4E7 631 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 VPS54Q9P1Q0 977 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 SORCS3Q9UPU3 1222 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 STK36Q9NRP7 1315 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 DENND4AQ7Z401 1863 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 E2F8A0AVK6 867 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 CPLX1O14810 134 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 ADAMTS3O15072 1205 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 INPPL1O15357 1258 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 CHMP2AO43633 222 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 EDIL3O43854 480 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 CDKL5O76039 1030 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 STBD1O95210 358 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 CTSAP10619 480 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 CPA1P15085 419 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 PSMC5P62195 406 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 MCL1Q07820 350 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 PPP2R5CQ13362 524 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 NPY5RQ15761 445 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 SPATS1Q496A3 300 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 LCE4AQ5TA78 99 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 CYP26C1Q6V0L0 522 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 BLIDQ8IZY5 108 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 CPA6Q8N4T0 437 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 NRG4Q8WWG1 115 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 PGBD4Q96DM1 585 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC51Q96ER9 411 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 IGSF21Q96ID5 467 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 FAM20AQ96MK3 541 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 C8orf49Q96NF6 230 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 A0A087WZ62 844 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 TDP2O95551 362 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 S100BP04271 92 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 XBP1P17861 261 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 PBX3P40426 434 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-222ENST00000514552 QARSP47897 775 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
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