RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	EID2B	Q96D98	161 aa		5.1	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		5.1	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		5.1	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	A2M	P01023	1474 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	DNPH1	O43598	174 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	USP12	O75317	370 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	CER1	O95813	267 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	ITGA2B	P08514	1039 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	PRR35	P0CG20	571 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	KEL	P23276	732 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	KLRK1	P26718	216 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	VPS41	P49754	854 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	MYBPC2	Q14324	1141 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	KRT72	Q14CN4	511 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	RMDN3	Q96TC7	470 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	YY1AP1	Q9H869	796 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	DACT1	Q9NYF0	836 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	LRFN1	Q9P244	771 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GFM2-208	ENST00000513331	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331		M0QZQ0	153 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	FCHO1	O14526	889 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	PEX14	O75381	377 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	TNFRSF6B	O95407	300 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	NDUFS1	P28331	727 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	SLC8A1	P32418	973 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	HOXD12	P35452	270 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	SERPINF1	P36955	418 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	ABCG1	P45844	678 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC38	Q502W7	563 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	WDR93	Q6P2C0	686 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	C16orf89	Q6UX73	402 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	CNGA4	Q8IV77	575 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	NPIPB3	Q92617	1050 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	MAP4K1	Q92918	833 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	TRIM2	Q9C040	744 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	LRP6	O75581	1613 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	VGLL3	A8MV65	326 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	PRY	O14603	147 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	NKX2-8	O15522	239 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	THBS4	P35443	961 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	AGTR2	P50052	363 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	HSF1	Q00613	529 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	GHRHR	Q02643	423 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	GAB1	Q13480	694 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	TRIM14	Q14142	442 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	SEC23B	Q15437	767 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	AAK1	Q2M2I8	961 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	MTX3	Q5HYI7	312 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	UEVLD	Q8IX04	471 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	LAS2	Q8IYD9	372 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	ASB12	Q8WXK4	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	CUL5	Q93034	780 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6

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