RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 KIF19Q2TAC6 998 aa17.54■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 FSCBQ5H9T9 825 aa17.54■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa17.54■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 TAC4Q86UU9 113 aa17.54■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 ACADSBP45954 432 aa17.53■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 TEAD4Q15561 434 aa17.53■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 SGK2Q9HBY8 427 aa17.53■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 TM9SF3Q9HD45 589 aa17.53■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 LAYNQ6UX15 382 aa17.52■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 BEND5Q7L4P6 421 aa17.52■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 USP30Q70CQ3 517 aa17.51■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 TMEM110Q86TL2 294 aa17.51■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 CHSY1Q86X52 802 aa17.51■□□□□ 0.39
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HERC3-211ENST00000513325 TRIM62Q9BVG3 475 aa17.51■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 POPDC2Q9HBU9 364 aa17.51■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 SERGEFQ9UGK8 458 aa17.51■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 SCML1Q9UN30 329 aa17.51■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 CHD6Q8TD26 2715 aa17.51■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 ASPMQ8IZT6 3477 aa17.51■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 FLRT2O43155 660 aa17.5■□□□□ 0.39
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HERC3-211ENST00000513325 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 ARID5BQ14865 1188 aa17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
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HERC3-211ENST00000513325 KCNT1Q5JUK3 1230 aa17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 C9orf64Q5T6V5 341 aa17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 KIAA0895LQ68EN5 471 aa17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 CREBRFQ8IUR6 639 aa17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 APCDD1Q8J025 514 aa17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 KDM1BQ8NB78 822 aa17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 MED15Q96RN5 788 aa17.5■□□□□ 0.39
HERC3-211ENST00000513325 CRACR2AQ9BSW2 395 aa17.5■□□□□ 0.39
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