RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	CLIC2	O15247	247 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	FFAR2	O15552	330 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	BMP15	O95972	392 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	GP1BA	P07359	652 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	GOT1	P17174	413 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	CD70	P32970	193 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	CYP2J2	P51589	502 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	TLE1	Q04724	770 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	OVGP1	Q12889	678 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	UNC93A	Q86WB7	457 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	EXTL1	Q92935	676 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	LRRK2	Q5S007	2527 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
FAM53C-208	ENST00000511276	TGFB1I1	O43294	461 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	STX6	O43752	255 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	KIF20A	O95235	890 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	GIMD1	P0DJR0	217 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CR2	P20023	1033 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PSMD8	P48556	350 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CASP4	P49662	377 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SGSH	P51688	502 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF445	P59923	1031 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ST8SIA6	P61647	398 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	NCOA4	Q13772	614 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	C4orf17	Q53FE4	359 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	MAPK15	Q8TD08	544 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	APOLD1	Q96LR9	279 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	BSN	Q9UPA5	3926 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276		H3BQV1	296 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	VNN1	O95497	513 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM87A	P0C7U9	286 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	P4HA1	P13674	534 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	TGM2	P21980	687 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	STAT4	Q14765	748 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	USP53	Q70EK8	1073 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	TTC17	Q96AE7	1141 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	TWNK	Q96RR1	684 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM129B	Q96TA1	746 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SEMA3C	Q99985	751 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	WDR70	Q9NW82	654 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276		U3KQA8	63 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	NOTCH2	Q04721	2471 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ITGB2	P05107	769 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SFTPC	P11686	197 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	C5AR1	P21730	350 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SERINC3	Q13530	473 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ARID5B	Q14865	1188 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ADGRF1	Q5T601	910 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CLEC14A	Q86T13	490 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ARL14	Q8N4G2	192 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	IFI44	Q8TCB0	444 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SGF29	Q96ES7	293 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	DUSP16	Q9BY84	665 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	DMTF1	Q9Y222	760 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	RELN	P78509	3460 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	RP1	P56715	2156 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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