RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX16P57768 344 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 TCEAL6Q6IPX3 200 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 SDE2Q6IQ49 451 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXL22Q6P050 247 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 C14orf80Q86SX3 495 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 UCMAQ8WVF2 138 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 TCEAL3Q969E4 200 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO19Q96H55 970 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 TTYH3Q9C0H2 523 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 MTG2Q9H4K7 406 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 VANGL2Q9ULK5 521 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 STAP1Q9ULZ2 295 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP8B1Q9UNU6 501 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
SH3BP2-218ENST00000511185 EPHX1P07099 455 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 MPLP40238 635 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 CSKP41240 450 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 COPAP53621 1224 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 PITRM1Q5JRX3 1037 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 BNIPLQ7Z465 357 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 MSANTD4Q8NCY6 345 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52K2Q8NGK3 314 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 FIBINQ8TAL6 211 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 RMDN1Q96DB5 314 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 SPACA7Q96KW9 195 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 SYT11Q9BT88 431 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 TKTL2Q9H0I9 626 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM245Q9H330 911 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 GON4LQ3T8J9 2241 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC2A3P11169 496 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 NSFP46459 744 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 CXCR3P49682 368 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 DEUP1Q05D60 604 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 AUHQ13825 339 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 STARD3Q14849 445 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 ELF2Q15723 593 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A52Q3SY17 297 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 ARTNQ5T4W7 220 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM72Q6ZMU5 477 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR23CQ6ZRP0 262 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 MON1BQ7L1V2 547 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAAF5Q86Y56 855 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEFF1Q8IYR6 380 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 APCDD1Q8J025 514 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB119Q8N690 84 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 AGPAT1Q99943 283 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 RXFP3Q9NSD7 469 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 TAS2R14Q9NYV8 317 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM131Q92545 1883 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 H0Y626 953 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 GDF9O60383 454 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINC1P01008 464 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 PDGFRAP16234 1089 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 PTGER3P43115 390 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP11AP98196 1134 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 FANCCQ00597 558 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 CREB5Q02930 508 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 CDO1Q16878 200 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 PLA2G2CQ5R387 149 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM131BQ86XD5 332 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF683Q8IZ20 524 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 LOXL4Q96JB6 756 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 MRGPRX3Q96LB0 322 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 SIK2Q9H0K1 926 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1B0GVM2 712 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PQC6 194 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 TCAF2A6NFQ2 919 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 NPC1O15118 1278 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 LRP3O75074 770 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 CNTN5O94779 1100 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 DLDP09622 509 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 FERP16591 822 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 PTMSP20962 102 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 RDXP35241 583 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 STK19P49842 368 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 GSCP56915 257 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
SH3BP2-218ENST00000511185 NR1I3Q14994 352 aa19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms