RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 BCAR1P56945 870 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 VBP1P61758 197 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 SPEM2Q0P670 501 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 DGKDQ16760 1214 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 RGS21Q2M5E4 152 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 NOTUMQ6P988 496 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC62Q6P9F0 684 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 DDIASQ8IXT1 998 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 KDM8Q8N371 416 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 OXR1Q8N573 874 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 SETD9Q8NE22 299 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 NEK11Q8NG66 645 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 TCP11Q8WWU5 503 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 DPF1Q92782 380 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 WNT8BQ93098 351 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 RGMAQ96B86 450 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 PTERQ96BW5 349 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 SUSD3Q96L08 255 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 CAMK1GQ96NX5 476 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 GCNAQ96QF7 691 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 ZBTB18Q99592 522 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 OSMRQ99650 979 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 TPPP3Q9BW30 176 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 KLHL4Q9C0H6 718 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 MLXIPQ9HAP2 919 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 LY9Q9HBG7 655 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 CYP39A1Q9NYL5 469 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 TUBE1Q9UJT0 475 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 ASXL2Q76L83 1435 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 HEATR9A2RTY3 570 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 MYO1GB0I1T2 1018 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 PPEF2O14830 753 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 PIP5K1BO14986 540 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 STRNO43815 780 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 CBFA2T3O75081 653 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 PPP6R2O75170 966 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 GUCY1B2O75343 617 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 RHOBTB1O94844 696 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 EGFRP00533 1210 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 PFKMP08237 780 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 CHRM3P20309 590 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 ANXA13P27216 316 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 ARNTP27540 789 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 EVI2BP34910 448 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 MAGEA1P43355 309 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 LIG4P49917 911 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 AMPD2Q01433 879 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 ABRQ12979 859 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 SCGB2A2Q13296 93 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 PDCD1Q15116 288 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 CHRNA6Q15825 494 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 CFAP157Q5JU67 520 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 COLEC12Q5KU26 742 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 ARMCX2Q7L311 632 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 SPATA21Q7Z572 469 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCD4-211ENST00000498367 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms