RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493711.1

SNX17-208, Transcript of sorting nexin 17, human

TSL 3

Gene SNX17, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX17-208	ENST00000493711	GFRA2	O00451	464 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	CES2	O00748	559 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	CREB3	O43889	395 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	CLDN11	O75508	207 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	RHOQ	P17081	205 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	EPHB2	P29323	1055 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	HOXC13	P31276	330 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	ARSE	P51690	589 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	AMPD2	Q01433	879 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	TFDP2	Q14188	446 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	PPP2R5E	Q16537	467 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	FBXL22	Q6P050	247 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	RFX8	Q6ZV50	586 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	CHST9	Q7L1S5	443 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	LZTR1	Q8N653	840 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	FGF14	Q92915	247 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	IRF7	Q92985	503 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	WBP2	Q969T9	261 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	EXOC4	Q96A65	974 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	CALN1	Q9BXU9	219 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	MARK1	Q9P0L2	795 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	NCOR1	O75376	2440 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711		A0A1B0GVM2	712 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	WASH4P	A8MWX3	477 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711		I6L893	689 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	KCNK3	O14649	394 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	SRGAP2	O75044	1071 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	LRIG2	O94898	1065 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	BMP1	P13497	986 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	IL9	P15248	144 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	CDH4	P55283	916 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	PFKP	Q01813	784 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	GAD2	Q05329	585 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	TUBB2A	Q13885	445 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	DPYSL3	Q14195	570 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	TAZ	Q16635	292 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	CA9	Q16790	459 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	EML3	Q32P44	896 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	DDI1	Q8WTU0	396 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	RAPGEF5	Q92565	580 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	TSC1	Q92574	1164 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	ALG3	Q92685	438 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	KRT35	Q92764	455 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	DNASE1L2	Q92874	299 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	FAF2	Q96CS3	445 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	WDR24	Q96S15	920 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	BRD9	Q9H8M2	597 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	KCNK12	Q9HB15	430 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	DNAI1	Q9UI46	699 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	SNX12	Q9UMY4	172 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		12.81	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	REV3L	O60673	3130 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	MYH10	P35580	1976 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		12.8	□□□□□ -0.36
SNX17-208	ENST00000493711	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36

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