RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 RBL1P28749 1068 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 FOXN2P32314 431 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PCK1P35558 622 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PBX2P40425 430 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SLC6A3Q01959 620 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 DNAJC3Q13217 504 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.24□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PIGWQ7Z7B1 504 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 FIBCD1Q8N539 461 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 NAT8LQ8N9F0 302 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SLC2A14Q8TDB8 520 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.252e-10■■■■□ 20.3
HERC4-211ENST00000492996 FAF2Q96CS3 445 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TTC25Q96NG3 672 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 RNF157Q96PX1 679 aa7.24□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SNX25Q9H3E2 840 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 WNT16Q9UBV4 365 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 KPNA7A9QM74 516 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CLDN5O00501 218 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SNX3O60493 162 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TCEA3O75764 348 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ELK3P41970 407 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SCTRP47872 440 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 HDAC4P56524 1084 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TFDP2Q14188 446 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CYB5D1Q6P9G0 228 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 GPR149Q86SP6 731 aa7.24□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 RELL1Q8IUW5 271 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 MAP7D3Q8IWC1 876 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PLD5Q8N7P1 536 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SLC35F5Q8WV83 523 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CKAP2Q8WWK9 683 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CCT6BQ92526 530 aa7.24□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 SMC6Q96SB8 1091 aa7.24□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SLC28A3Q9HAS3 691 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 HAUS2Q9NVX0 235 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 DUSP12Q9UNI6 340 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.24□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 CTSHP09668 335 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 IMPDH2P12268 514 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 KRT4P19013 534 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 IL4RP24394 825 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PRKCQQ04759 706 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 NOMO1Q15155 1222 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TAZQ16635 292 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ACCSLQ4AC99 568 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TMEM31Q5JXX7 168 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 FAM131BQ86XD5 332 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PYROXD2Q8N2H3 581 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PQLC3Q8N755 202 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ATP11CQ8NB49 1132 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PGBD4Q96DM1 585 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CFAP36Q96G28 342 aa7.23□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 EURLQ9NYK6 297 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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