RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 LGSNQ5TDP6 509 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 RNF220Q5VTB9 566 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 PID1Q7Z2X4 250 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 TTC7BQ86TV6 843 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 SYBUQ9NX95 663 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 STAP1Q9ULZ2 295 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 E2F8A0AVK6 867 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 ARL5CA6NH57 179 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 SDR42E2A6NKP2 422 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 DCLK1O15075 740 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 SMIM24O75264 130 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 DLDP09622 509 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 HOXC8P31273 242 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 BST1Q10588 318 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 BLMHQ13867 455 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 PDK1Q15118 436 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 ANO7Q6IWH7 933 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 FAM13CQ8NE31 585 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 HASPINQ8TF76 798 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 UCMAQ8WVF2 138 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 PGBD4Q96DM1 585 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 C20orf27Q9GZN8 174 aa13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
PRAME-213ENST00000492657 THP07101 528 aa13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 KITP10721 976 aa13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 FDFT1P37268 417 aa13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 CCNFP41002 786 aa13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 RGS2P41220 211 aa13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 CHI3L2Q15782 390 aa13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 TIGD5Q53EQ6 642 aa13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 C17orf99Q6UX52 265 aa13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 AGMOQ6ZNB7 445 aa13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 NPWQ8N729 165 aa13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 PHC3Q8NDX5 983 aa13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 KATNAL1Q9BW62 490 aa13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 DDIT4Q9NX09 232 aa13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 ZFATQ9P243 1243 aa13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 GSTA2P09210 222 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 ERVK-10P10266 1014 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 MYL2P10916 166 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 TMPRSS15P98073 1019 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 PARP6Q2NL67 630 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 LRRC8BQ6P9F7 803 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 NUDCD3Q8IVD9 361 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 OR52K1Q8NGK4 314 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 DNAI2Q9GZS0 605 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 TSC2P49815 1807 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 OPHN1O60890 802 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 POMCP01189 267 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 YY1P25490 414 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 GLUD2P49448 558 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 ZBTB16Q05516 673 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 E2F7Q96AV8 911 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 TRPM7Q96QT4 1865 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 GORASP1Q9BQQ3 440 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 RTP3Q9BQQ7 232 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 BATF3Q9NR55 127 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 ARMCX1Q9P291 453 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 TRPV2Q9Y5S1 764 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 ZNF236Q9UL36 1845 aa13.2□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 HHLA1C9JL84 531 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 STK10O94804 968 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 TOMM70O94826 608 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 BRCC3P46736 316 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 RASSF2P50749 326 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 STEAP4Q687X5 459 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 TAF2Q6P1X5 1199 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 PACS1Q6VY07 963 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 BHLHA9Q7RTU4 235 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 RASAL3Q86YV0 1011 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 STKLD1Q8NE28 680 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 ZNF398Q8TD17 642 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 INPP5DQ92835 1189 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 NUDCD1Q96RS6 583 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 TSPAN18Q96SJ8 248 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 APOL2Q9BQE5 337 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 M0QZ92 97 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 MGEA5O60502 916 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 LTFP02788 710 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 PTPN3P26045 913 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 TPI1P60174 286 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 MXRA7P84157 204 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 NIPAL4Q0D2K0 466 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 PPM1JQ5JR12 505 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 TMEM209Q96SK2 561 aa13.19□□□□□ -0.3
PRAME-213ENST00000492657 APBA2Q99767 749 aa13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms