RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 RPS6KA3P51812 740 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SOX10P56693 466 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 CYP4F2P78329 520 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM65Q6PI78 240 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 VRK3Q8IV63 474 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 KCNJ9Q92806 393 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC17Q96LX7 622 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ALKBH4Q9NXW9 302 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 AASSQ9UDR5 926 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM191CA6NGB0 347 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 H7C1Q1 480 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 NARSO43776 548 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF202O95125 648 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 KAT7O95251 611 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 STAT6P42226 847 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 OAZ1P54368 228 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SLC37A1P57057 533 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 GAB1Q13480 694 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 KCNB1Q14721 858 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ULK2Q8IYT8 1036 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 BEND2Q8NDZ0 799 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A11Q9NSA0 550 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D22BQ9NU19 505 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A13Q9UJS0 675 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 GCATO75600 419 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ABCD3P28288 659 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 RARRES1P49788 294 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 HECTD2Q5U5R9 776 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF366Q8N895 744 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TOR3AQ9H497 397 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 KLQ9UEF7 1012 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 MAFFQ9ULX9 164 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 NPIPB13A6NJU9 1138 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 NPIPB4C9JG80 1138 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 PRYO14603 147 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 JTBO76095 146 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ENO1P06733 434 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 CYP4B1P13584 511 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 PRPH2P23942 346 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 VPS41P49754 854 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC30Q5VVM6 783 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 NCSTNQ92542 709 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 GPR78Q96P69 363 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 IL21RQ9HBE5 538 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 VEZTQ9HBM0 779 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ASNSD1Q9NWL6 643 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ASIC5Q9NY37 505 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 KAT6AQ92794 2004 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 NPIPB8E9PQR5 432 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SPTLC2O15270 562 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 LDHCP07864 332 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 TGM2P21980 687 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 CHMP24386 653 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 CCT4P50991 539 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 MVDP53602 400 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRC-212ENST00000491302 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms