RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486621.1

TTC4-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 4, human

TSL 2

Gene TTC4, Length 549 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC4-204	ENST00000486621	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621		A0A1B0GUA9	196 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	TMEM150B	A6NC51	233 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	MYMK	A6NI61	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621		I3L4J1	428 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	PTGES	O14684	152 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	CYP3A4	P08684	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	CLDN6	P56747	220 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF445	P59923	1031 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	PTEN	P60484	403 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	NAB2	Q15742	525 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	UPP1	Q16831	310 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	TMEM143	Q96AN5	459 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	CCL26	Q9Y258	94 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	NID2	Q14112	1375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	MED13	Q9UHV7	2174 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	SVIL	O95425	2214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	NBAS	A2RRP1	2371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	SMCO2	A6NFE2	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	MEI4	A8MW99	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	CHMP2A	O43633	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	GREM1	O60565	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	GAS7	O60861	476 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	RECQL4	O94761	1208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	STBD1	O95210	358 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	APOD	P05090	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	CALM1	P0DP23	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	CALM2	P0DP24	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	CALM3	P0DP25	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	ITGB6	P18564	788 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	IFNAR2	P48551	515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	ADCY7	P51828	1080 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	TFDP1	Q14186	410 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	NCAPH	Q15003	741 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	IGFBP7	Q16270	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	TAF12	Q16514	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	LINC00303	Q3SY05	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	PRR16	Q569H4	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	BRF1	Q92994	677 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	CEP170P1	Q96L14	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	RIT2	Q99578	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	DCTPP1	Q9H773	170 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TTC4-204	ENST00000486621	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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