RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486042.1

PHC3-211, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

TSL 3

Gene PHC3, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-211ENST00000486042 SIRT6Q8N6T7 355 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 HMGB4Q8WW32 186 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 CPT1BQ92523 772 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 TWSG1Q9GZX9 223 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 RIC8AQ9NPQ8 531 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 PDGFCQ9NRA1 345 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 TXLNGQ9NUQ3 528 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 DLL3Q9NYJ7 618 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 NDUFAF4Q9P032 175 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 PDP2Q9P2J9 529 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 SWAP70Q9UH65 585 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 ANAPC4Q9UJX5 808 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 GJD2Q9UKL4 321 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 ASAP1Q9ULH1 1129 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa4.03□□□□□ -1.76
PHC3-211ENST00000486042 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 E7EVH7 732 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 M0QZQ0 153 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 CA12O43570 354 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 LARGE1O95461 756 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 TK1P04183 234 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 ENGP17813 658 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 CD53P19397 219 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 MMP8P22894 467 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 CYP2C18P33260 490 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 ACTR2P61160 394 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 PSG6Q00889 435 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 TBC1D25Q3MII6 688 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 GALNTL6Q49A17 601 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 WDR78Q5VTH9 848 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 MTHFD1LQ6UB35 978 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 RINLQ6ZS11 566 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 KRT27Q7Z3Y8 459 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 OR4N4Q8N0Y3 316 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 IL17REQ8NFR9 667 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 MECRQ9BV79 373 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 HIPK2Q9H2X6 1198 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 CCDC134Q9H6E4 229 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 DUSP22Q9NRW4 184 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 MGAT4CQ9UBM8 478 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 AMFRQ9UKV5 643 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa4.02□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 A0A1B0GVC2 190 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 SLC38A8A6NNN8 435 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 M0QYT0 321 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 TMPRSS11DO60235 418 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 KRT38O76015 456 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 ALADP13716 330 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 RXRAP19793 462 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 BDNFP23560 247 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 CNTFP26441 200 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 SERPINA4P29622 427 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 THBS4P35443 961 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 DNASE1L3Q13609 305 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 AAK1Q2M2I8 961 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 ZNF569Q5MCW4 686 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 SYT13Q7L8C5 426 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 LRRTM4Q86VH4 590 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 CPOQ8IVL8 374 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 ABHD11Q8NFV4 315 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 GOLGA1Q92805 767 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 COG8Q96MW5 612 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 TRMOQ9BU70 441 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 FSD1LQ9BXM9 530 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 CHODLQ9H9P2 273 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 SAP30LQ9HAJ7 183 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 KCNK9Q9NPC2 374 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 VPS45Q9NRW7 570 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 GGA3Q9NZ52 723 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 ZNF69Q9UC07 566 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 KCND3Q9UK17 655 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.01□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 SERINC4A6NH21 518 aa4□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa4□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 EYA2O00167 538 aa4□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 QSOX1O00391 747 aa4□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 NKX2-8O15522 239 aa4□□□□□ -1.77
PHC3-211ENST00000486042 TFRCP02786 760 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms