RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 GRIK2Q13002 908 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 MAN2A1Q16706 1144 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 DCAF6Q58WW2 860 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 PIP4P1Q86T03 277 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 PASD1Q8IV76 773 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 LGI2Q8N0V4 545 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 SNX19Q92543 992 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 NOX5Q96PH1 765 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 CPXM1Q96SM3 734 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 PCED1AQ9H1Q7 454 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 SUN2Q9UH99 717 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-218ENST00000479554 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 H0Y626 953 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 MOCS3O95396 460 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 IGLV3-25P01717 112 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 TACR2P21452 398 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PTK2Q05397 1052 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ZBTB16Q05516 673 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 TTC17Q96AE7 1141 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 LMLNQ96KR4 655 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 BPIFA3Q9BQP9 254 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SIX2Q9NPC8 291 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 DACH1Q9UI36 760 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PCDHGC3Q9UN70 934 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 F5H5T6 163 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 HSF2BPO75031 334 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 GLI1P08151 1106 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 C7P10643 843 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ACSL1P33121 698 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 KRT9P35527 623 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 CDK17Q00537 523 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SLC14A1Q13336 389 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 TAF5Q15542 800 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 FSCBQ5H9T9 825 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 DEFB106AQ8N104 65 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 WDTC1Q8N5D0 677 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 MYO19Q96H55 970 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 MTG2Q9H4K7 406 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 DDIT4Q9NX09 232 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 COX16Q9P0S2 106 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 CEP83Q9Y592 693 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ASPMQ8IZT6 3477 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 USP24Q9UPU5 2620 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 KCNU1A8MYU2 1149 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 GJB3O75712 270 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 GRAP2O75791 330 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SEMA4FO95754 770 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SLC2A3P11169 496 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 CD59P13987 128 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SPINK2P20155 84 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 ABCB4P21439 1286 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 CCR1P32246 355 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SNX16P57768 344 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 IQCB1Q15051 598 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-218ENST00000479554 VWA3BQ502W6 1294 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms