RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA8RI6L899 631 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 M0QZ92 97 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GABRDO14764 452 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TIMM44O43615 452 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GRAP2O75791 330 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CIB2O75838 187 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 METTL18O95568 372 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SERPINE1P05121 402 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 FAM200BP0CF97 657 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ZNF286BP0CG31 522 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TPBGLP0DKB5 382 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 MYL2P10916 166 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 COL6A2P12110 1019 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 LCP1P13796 627 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GNAZP19086 355 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 BGNP21810 368 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PCSK1P29120 753 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PRDX6P30041 224 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ADRA1BP35368 520 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GP5P40197 560 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PSEN2P49810 448 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 LILRA4P59901 499 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 IRX4P78413 519 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PDE1BQ01064 536 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 DEUP1Q05D60 604 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 NIPAL4Q0D2K0 466 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 BST1Q10588 318 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 MFSD10Q14728 455 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.017e-71■■■■□ 22.5
ACTB-208ENST00000464611 SNX17Q15036 470 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CA9Q16790 459 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 FSCBQ5H9T9 825 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TLK2Q86UE8 772 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PIGZQ86VD9 579 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 DEFB106AQ8N104 65 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 KIF2BQ8N4N8 673 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 LZTR1Q8N653 840 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 RDH11Q8TC12 318 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 RNF139Q8WU17 664 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SPOCK2Q92563 424 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 STMN2Q93045 179 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ISL2Q96A47 359 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ZNF333Q96JL9 665 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 MCOLN1Q9GZU1 580 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 C10orf88Q9H8K7 445 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 FNIP2Q9P278 1114 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA8OA6NCC3 632 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 VGLL3A8MV65 326 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TMEM114B3SHH9 223 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GOLGA8NF8WBI6 632 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SLCO1B7G3V0H7 640 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 RNF103O00237 685 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 FCHO1O14526 889 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CYB561D2O14569 222 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CAPN9O14815 690 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SLC22A2O15244 555 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 DIAPH2O60879 1101 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PEX11AO75192 247 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 FKBP6O75344 327 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 AVILO75366 819 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 USP1O94782 785 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SKIP12755 728 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ACADSP16219 412 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 AOC1P19801 751 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 AMPD1P23109 780 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ADORA2BP29275 332 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SERPINB3P29508 390 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 VHLP40337 213 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GBE1Q04446 702 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TRIM32Q13049 653 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CHI3L2Q15782 390 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CCDC6Q16204 474 aa8.73□□□□□ -1.01
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