RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 FERP16591 822 aa24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 MPLP40238 635 aa24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 ID4P47928 161 aa24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 CXCR3P49682 368 aa24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 FSCBQ5H9T9 825 aa24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 BRMS1LQ5PSV4 323 aa24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 FBXL22Q6P050 247 aa24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 PRR23CQ6ZRP0 262 aa24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 AGPAT1Q99943 283 aa24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 HS3ST4Q9Y661 456 aa24.77■■□□□ 1.56
SMKR1-201ENST00000462322 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1B0GTH6 734 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ADCY5O95622 1261 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 UNGP13051 313 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 CSKP41240 450 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGAP8P85298 464 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 AUHQ13825 339 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 PTPRNQ16849 979 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 LUZP1Q86V48 1076 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 TMEFF1Q8IYR6 380 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 TTC17Q96AE7 1141 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 TKTL2Q9H0I9 626 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 SIK2Q9H0K1 926 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM51Q9NW97 253 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ADAM22Q9P0K1 906 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 VANGL2Q9ULK5 521 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 CYP8B1Q9UNU6 501 aa24.76■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 MOCS3O95396 460 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF806P0C7X5 589 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 GGCXP38435 758 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 CENPCQ03188 943 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 PITRM1Q5JRX3 1037 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 TRNP1Q6NT89 227 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 SLC36A4Q6YBV0 504 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ARCQ7LC44 396 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 CYP2U1Q7Z449 544 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 TMPRSS6Q8IU80 811 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 EMC1Q8N766 993 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF366Q8N895 744 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 RMDN1Q96DB5 314 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 CFAP57Q96MR6 1250 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM245Q9H330 911 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 VPS45Q9NRW7 570 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 MYO6Q9UM54 1294 aa24.75■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1B0GVM2 712 aa24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1W2PQC6 194 aa24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 TCAF2A6NFQ2 919 aa24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 CAVIN2O95810 425 aa24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ASLP04424 464 aa24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ST8SIA6P61647 398 aa24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 PLA2G2CQ5R387 149 aa24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ARMCX6Q7L4S7 300 aa24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 BAP1Q92560 729 aa24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 IGSF8Q969P0 613 aa24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 SIPA1Q96FS4 1042 aa24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 SMOC1Q9H4F8 434 aa24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa24.74■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 GON4LQ3T8J9 2241 aa24.73■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 CKAP5Q14008 2032 aa24.73■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 AP5Z1O43299 807 aa24.73■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 RDXP35241 583 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 NR1I3Q14994 352 aa24.73■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 PLEKHG6Q3KR16 790 aa24.73■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 SPDYCQ5MJ68 293 aa24.73■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa24.73■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 C14orf80Q86SX3 495 aa24.73■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 ANLNQ9NQW6 1124 aa24.73■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC53A6NM62 1247 aa24.72■■□□□ 1.55
SMKR1-201ENST00000462322 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms