RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF653Q96CK0 615 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 HAPLN3Q96S86 360 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ACOX2Q99424 681 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ISCUQ9H1K1 167 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 HCN2Q9UL51 889 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 PLA2G4CQ9UP65 541 aa22.12■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 A0A1B0GVM2 712 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 TCAF2A6NFQ2 919 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 PROB1E7EW31 1015 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 AXIN1O15169 862 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ADAM23O75077 832 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 MOCS3O95396 460 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 HOXB2P14652 356 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 HOXC13P31276 330 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 CD70P32970 193 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 CNR2P34972 360 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 GGCXP38435 758 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 LMAN2Q12907 356 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 MAMLD1Q13495 774 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 MBLAC2Q68D91 279 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 TMC6Q7Z403 805 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 IGSF8Q969P0 613 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 C1orf74Q96LT6 269 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 CNPY3Q9BT09 278 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.11■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 LILRB5O75023 590 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 OXCT1P55809 520 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM215Q68D42 235 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ANO7Q6IWH7 933 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 C14orf80Q86SX3 495 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 PGBD3Q8N328 593 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 SORCS1Q8WY21 1168 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 DNAJC7Q99615 494 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 GABRG3Q99928 467 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 DEF6Q9H4E7 631 aa22.1■■□□□ 1.13
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ABCD4-202ENST00000460308 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 EBF1Q9UH73 591 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 STON1Q9Y6Q2 735 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 SCINQ9Y6U3 715 aa22.1■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 A0A087X0T9 212 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 AP5Z1O43299 807 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 CCP110O43303 1012 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 SRGAP2O75044 1071 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 FAM228BP0C875 321 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ADRA1BP35368 520 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 HDAC4P56524 1084 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 STARD3Q14849 445 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 RAB6CQ53S08 254 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 FSCBQ5H9T9 825 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC122Q5T0U0 273 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ADIPOR2Q86V24 386 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 CNGA4Q8IV77 575 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.09■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa22.08■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 WASH3PC4AMC7 463 aa22.08■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 I6L893 689 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 MFAP3LO75121 409 aa22.08■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 CLDN11O75508 207 aa22.08■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 DLDP09622 509 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 PSMA2P25787 234 aa22.08■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 CDH4P55283 916 aa22.08■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 SLC12A1Q13621 1099 aa22.08■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF234Q14588 700 aa22.08■■□□□ 1.13
ABCD4-202ENST00000460308 C5orf22Q49AR2 442 aa22.08■■□□□ 1.13
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