RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 IGSF8Q969P0 613 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5-208ENST00000459627 SIK2Q9H0K1 926 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5-208ENST00000459627 RAB6CQ9H0N0 254 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5-208ENST00000459627 CBX8Q9HC52 389 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5-208ENST00000459627 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP5-208ENST00000459627 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5-208ENST00000459627 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5-208ENST00000459627 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
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SH3BP5-208ENST00000459627 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5-208ENST00000459627 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
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SH3BP5-208ENST00000459627 CSKP41240 450 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5-208ENST00000459627 PTGER3P43115 390 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP5-208ENST00000459627 FBXL22Q6P050 247 aa24.71■■□□□ 1.55
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SH3BP5-208ENST00000459627 CFAP57Q96MR6 1250 aa24.71■■□□□ 1.55
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SH3BP5-208ENST00000459627 HS3ST4Q9Y661 456 aa24.71■■□□□ 1.55
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SH3BP5-208ENST00000459627 TIMM44O43615 452 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 LRP3O75074 770 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 COPAP53621 1224 aa24.7■■□□□ 1.54
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SH3BP5-208ENST00000459627 DEUP1Q05D60 604 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 CYP2U1Q7Z449 544 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 MSANTD4Q8NCY6 345 aa24.7■■□□□ 1.54
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SH3BP5-208ENST00000459627 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
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SH3BP5-208ENST00000459627 PLA2G4CQ9UP65 541 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa24.69■■□□□ 1.54
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SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF806P0C7X5 589 aa24.69■■□□□ 1.54
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SH3BP5-208ENST00000459627 PITRM1Q5JRX3 1037 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 PLA2G2CQ5R387 149 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 LPCAT2Q7L5N7 544 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 JOSD2Q8TAC2 188 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM245Q9H330 911 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 STAP1Q9ULZ2 295 aa24.69■■□□□ 1.54
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SH3BP5-208ENST00000459627 NUP205Q92621 2012 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 NPC1O15118 1278 aa24.68■■□□□ 1.54
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SH3BP5-208ENST00000459627 MMP8P22894 467 aa24.68■■□□□ 1.54
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SH3BP5-208ENST00000459627 CXCR3P49682 368 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP11AP98196 1134 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 PTP4A2Q12974 167 aa24.68■■□□□ 1.54
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SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 OR52K2Q8NGK3 314 aa24.68■■□□□ 1.54
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SH3BP5-208ENST00000459627 NT5C3BQ969T7 300 aa24.68■■□□□ 1.54
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SH3BP5-208ENST00000459627 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa24.68■■□□□ 1.54
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SH3BP5-208ENST00000459627 SLC25A52Q3SY17 297 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 TTC17Q96AE7 1141 aa24.67■■□□□ 1.54
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SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 CEP192Q8TEP8 1941 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A1B0GTH6 734 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 CNTN5O94779 1100 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 ITPKAP23677 461 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 CDO1Q16878 200 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 RABGAP1LQ5R372 815 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM72Q6ZMU5 477 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM124AQ86V42 546 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM131BQ86XD5 332 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa24.66■■□□□ 1.54
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