RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 GSTA2P09210 222 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PRKCHP24723 683 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PMLP29590 882 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC6A3Q01959 620 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 MPP4Q96JB8 637 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 LRGUKQ96M69 825 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SNX15Q9NRS6 342 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ADA2Q9NZK5 511 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SNX10Q9Y5X0 201 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 GLRA3O75311 464 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CEP70Q8NHQ1 597 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 P2RY11Q96G91 374 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 GPR20Q99678 358 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PRDM12Q9H4Q4 367 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ELP3Q9H9T3 547 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SERPINE1P05121 402 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PYGLP06737 847 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ITGAXP20702 1163 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 FOLH1Q04609 750 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 WASHC5Q12768 1159 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CERCAMQ5T4B2 595 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 NAPRTQ6XQN6 538 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 NDNQ99608 321 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 RHBDL2Q9NX52 303 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A096LPK6 155 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ABLIM1O14639 778 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PDK2Q15119 407 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC2A14Q8TDB8 520 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ANLNQ9NQW6 1124 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 COPG2Q9UBF2 871 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM233B4DJY2 109 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 KLHL2O95198 593 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 C1QAP02745 245 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 COX4I1P13073 169 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CPOXP36551 454 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 GRIA2P42262 883 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 RBP5P82980 135 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 FLOT2Q14254 428 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 C6orf52Q5T4I8 152 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 OLFML1Q6UWY5 402 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 DEFB106AQ8N104 65 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 EPAS1Q99814 870 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 GORASP1Q9BQQ3 440 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CYP4F12Q9HCS2 524 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM159BA6NKW6 160 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PFKMP08237 780 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 TGM2P21980 687 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 NDUFV1P49821 464 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PLK1P53350 603 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 NAGLUP54802 743 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PDK1Q15118 436 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBTB46Q86UZ6 589 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 CMTM5Q96DZ9 223 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SPATA16Q9BXB7 569 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 BCO2Q9BYV7 579 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 SPATC1LQ9H0A9 340 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 TSPAN8P19075 237 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 L1CAMP32004 1257 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 GABRB2P47870 512 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 GHRHRQ02643 423 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 POU5F1BQ06416 359 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 FBXL19Q6PCT2 694 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 RCN3Q96D15 328 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRJ-202ENST00000440289 F8W8V4 182 aa18.71■□□□□ 0.58
PTPRJ-202ENST00000440289 M0QYT0 321 aa18.71■□□□□ 0.58
PTPRJ-202ENST00000440289 MX2P20592 715 aa18.71■□□□□ 0.58
PTPRJ-202ENST00000440289 SERPINB9P50453 376 aa18.71■□□□□ 0.58
PTPRJ-202ENST00000440289 NME5P56597 212 aa18.71■□□□□ 0.58
PTPRJ-202ENST00000440289 COG7P83436 770 aa18.71■□□□□ 0.58
PTPRJ-202ENST00000440289 ADIGQ0VDE8 80 aa18.71■□□□□ 0.58
PTPRJ-202ENST00000440289 MED10Q9BTT4 135 aa18.71■□□□□ 0.58
PTPRJ-202ENST00000440289 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.58
PTPRJ-202ENST00000440289 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa18.71■□□□□ 0.58
PTPRJ-202ENST00000440289 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBTB42B2RXF5 422 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRJ-202ENST00000440289 SNNO75324 88 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
PTPRJ-202ENST00000440289 CDK7P50613 346 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRJ-202ENST00000440289 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms