RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 OVGP1Q12889 678 aa25.95■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.95■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 ERP27Q96DN0 273 aa25.95■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SYBUQ9NX95 663 aa25.95■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 DCTN3O75935 186 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 PGAM1P18669 254 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 BGNP21810 368 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 EPHB2P29323 1055 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCNFP41002 786 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SERPINB4P48594 390 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 PARP9Q8IXQ6 854 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SCAMP5Q8TAC9 235 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 TSSK1BQ9BXA7 367 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLLPQ9Y342 182 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 LRIG2O94898 1065 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 FAM26DQ5JW98 314 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCNJLQ8IV13 435 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 KLHL29Q96CT2 875 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 AGAP3Q96P47 875 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 PCMTD2Q9NV79 361 aa25.94■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 KCNJ2P63252 427 aa25.93■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 TSPY1Q01534 308 aa25.93■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 OLIG2Q13516 323 aa25.93■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SUSD3Q96L08 255 aa25.93■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNF186Q9NXI6 227 aa25.93■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC17A6Q9P2U8 582 aa25.93■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 NQO1P15559 274 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 CRYMQ14894 314 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 NDUFAF2Q8N183 169 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SCML4Q8N228 414 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDKL2Q92772 493 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 HDAC11Q96DB2 347 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 GORASP1Q9BQQ3 440 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 DCTN4Q9UJW0 460 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 MX2P20592 715 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 PAX3P23760 479 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SERPINB6P35237 376 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 NIPAL4Q0D2K0 466 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 OR52K1Q8NGK4 314 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 RFWD2Q8NHY2 731 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 NAT9Q9BTE0 207 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 BRD8Q9H0E9 1235 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 MKS1Q9NXB0 559 aa25.92■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 MGRN1O60291 552 aa25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 ALDH1A1P00352 501 aa25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 CNTFP26441 200 aa25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 GARSP41250 739 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 GALNT2Q10471 571 aa25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 NLRP9Q7RTR0 991 aa25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 KIF2BQ8N4N8 673 aa25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARMC2Q8NEN0 867 aa25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIM33Q9UPN9 1127 aa25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 CEP350Q5VT06 3117 aa25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 C2CD2LO14523 706 aa25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP12O75317 370 aa25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 UNC5CO95185 931 aa25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCNB1P14635 433 aa25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF398Q8TD17 642 aa25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIM55Q9BYV6 548 aa25.91■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 AP2A1O95782 977 aa25.9■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 POLBP06746 335 aa25.9■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SRGAP2BP0DMP2 458 aa25.9■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZBTB17Q13105 803 aa25.9■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 ASRGL1Q7L266 308 aa25.9■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 RNF180Q86T96 592 aa25.9■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 MECRQ9BV79 373 aa25.9■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIM62Q9BVG3 475 aa25.9■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARHGEF37A1IGU5 675 aa25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 MTSS1O43312 755 aa25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 TYMPP19971 482 aa25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 CD68P34810 354 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 GRIK1P39086 918 aa25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 ACLYP53396 1101 aa25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLC5A3P53794 718 aa25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SNCBQ16143 134 aa25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 CES3Q6UWW8 571 aa25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 PACS1Q6VY07 963 aa25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 TIFABQ6ZNK6 161 aa25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 SIK2Q9H0K1 926 aa25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 ARHGEF3Q9NR81 526 aa25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 TXLNGQ9NUQ3 528 aa25.89■■□□□ 1.74
PLEKHF1-201ENST00000436066 B4GALT3O60512 393 aa25.89■■□□□ 1.73
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