RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 FGF13Q92913 245 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TOR3AQ9H497 397 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ZZEF1O43149 2961 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TEX28O15482 410 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJC6O75061 913 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CDC45O75419 566 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ECI2O75521 394 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 RECQL4O94761 1208 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 LY86O95711 162 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 GYPEP15421 78 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ATP5JP18859 108 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 HSD17B4P51659 736 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TRAF1Q13077 416 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 PLCB4Q15147 1175 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD45Q5TZF3 282 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 IL31RAQ8NI17 732 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 MDM1Q8TC05 714 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 APPBP2Q92624 585 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 NDC1Q9BTX1 674 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 DACT1Q9NYF0 836 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 LAMA4Q16363 1823 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 LNP1A1A4G5 178 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ENO4A6NNW6 628 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 K7ESF4 209 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 MAFGO15525 162 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 AKAP3O75969 853 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CHRNB1P11230 501 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 KLRC1P26715 233 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 HOXA6P31267 233 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ABCG1P45844 678 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 RABEP1Q15276 862 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 LIN9Q5TKA1 542 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 FAM228AQ86W67 206 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 HSCBQ8IWL3 235 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 URGCPQ8TCY9 931 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TTC14Q96N46 770 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 APOL6Q9BWW8 343 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CPVLQ9H3G5 476 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0U1RQF3 1178 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ZAR1LA6NP61 321 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 LEFTY2O00292 366 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 C1RP00736 705 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CCNE1P24864 410 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 FLT3P36888 993 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 SLC11A1P49279 550 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 GLUD2P49448 558 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-211ENST00000429595 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms