RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa2.74□□□□□ -1.97
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PTPRC-208ENST00000427110 HIC2Q96JB3 615 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-208ENST00000427110 UBXN10Q96LJ8 280 aa2.74□□□□□ -1.97
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PTPRC-208ENST00000427110 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
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PTPRC-208ENST00000427110 NUAK2Q9H093 628 aa2.74□□□□□ -1.97
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PTPRC-208ENST00000427110 ASNSD1Q9NWL6 643 aa2.74□□□□□ -1.97
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PTPRC-208ENST00000427110 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
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PTPRC-208ENST00000427110 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-208ENST00000427110 RMI1Q9H9A7 625 aa2.73□□□□□ -1.97
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PTPRC-208ENST00000427110 NOD2Q9HC29 1040 aa2.73□□□□□ -1.97
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PTPRC-208ENST00000427110 G6PC2Q9NQR9 355 aa2.73□□□□□ -1.97
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PTPRC-208ENST00000427110 TACR3P29371 465 aa2.72□□□□□ -1.97
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PTPRC-208ENST00000427110 CTXN3Q4LDR2 81 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM88Q6PEY1 159 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-208ENST00000427110 CYP26C1Q6V0L0 522 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-208ENST00000427110 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-208ENST00000427110 HERC6Q8IVU3 1022 aa2.72□□□□□ -1.97
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