RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 RALGPS1Q5JS13 557 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM131BQ86XD5 332 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 C10orf107Q8IVU9 208 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 GATA6Q92908 595 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PGLYRP2Q96PD5 576 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf21Q9H246 121 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SEPT10Q9P0V9 454 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 GABRQQ9UN88 632 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ASB3Q9Y575 518 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0A0MRY4 1105 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEA13PA6NCF6 341 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 GLRA4Q5JXX5 417 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 STEAP4Q687X5 459 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP2A3Q93084 1043 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA13Q96N96 652 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF487B1APH4 448 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 AOC2O75106 756 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ALDH1A2O94788 518 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 C17orf99Q6UX52 265 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 MAVSQ7Z434 540 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SIN3BO75182 1162 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGA2BP08514 1039 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 GNAT1P11488 350 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 EPHB1P54762 984 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 DSG1Q02413 1049 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 KYAT1Q16773 422 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 RABGAP1LQ5R372 815 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJB3Q8WWF6 145 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ARNTL2Q8WYA1 636 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF358Q9NW07 568 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SNTG2Q9NY99 539 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 TREHO43280 583 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 MFSD11O43934 449 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PGK1P00558 417 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ZCCHC18P0CG32 403 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ARRB2P32121 409 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX16P57768 344 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC26A9Q7LBE3 791 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC01465Q8N7H1 131 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ACMSDQ8TDX5 336 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PYDC1Q8WXC3 89 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP4F11Q9HBI6 524 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SYBUQ9NX95 663 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM216Q9P0N5 145 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 UNCXA6NJT0 531 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF103O00237 685 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 DGKIO75912 1065 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINE1P05121 402 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 FESP07332 822 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 F7P08709 466 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVK-10P10266 1014 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 FDFT1P37268 417 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ARL4AP40617 200 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC8BQ6P9F7 803 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 CYS1Q717R9 158 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP4R1Q8TF05 950 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ECSITQ9BQ95 431 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 COX16Q9P0S2 106 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SORCS3Q9UPU3 1222 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE5AO76074 875 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC10A3P09131 477 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMB4P28070 264 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 MLH1P40692 756 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 OLIG2Q13516 323 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC36Q1X8D7 754 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 STXBP5Q5T5C0 1151 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXB2Q5VYV0 432 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 RASSF3Q86WH2 238 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNYQ8ND76 341 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM40Q8WWA1 233 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 OLFM3Q96PB7 478 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SORT1Q99523 831 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 TXNDC16Q9P2K2 825 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 DCDC2Q9UHG0 476 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKCGP05129 697 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PGAM1P18669 254 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 TYK2P29597 1187 aa19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms