RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 KRT39Q6A163 491 aa7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 SPATC1Q76KD6 591 aa7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 SYT12Q8IV01 421 aa7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 NINJ1Q92982 152 aa7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 EEF2KMTQ96G04 330 aa7.31□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 GABRG3Q99928 467 aa7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 DUSP16Q9BY84 665 aa7.31□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM9BQ9NQ34 198 aa7.31□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 WDR35Q9P2L0 1181 aa7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 KLF15Q9UIH9 416 aa7.31□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 NAGPAQ9UK23 515 aa7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 FBXO10Q9UK96 956 aa7.31□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 A6NJY4 79 aa7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF202O95125 648 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 ITPKAP23677 461 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 HOXD12P35452 270 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 RAD23BP54727 409 aa7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 ITKQ08881 620 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 PPP2R5EQ16537 467 aa7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 RAB41Q5JT25 222 aa7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 C10orf120Q5SQS8 335 aa7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 PERM1Q5SV97 790 aa7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 LYSMD4Q5XG99 296 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 PIGZQ86VD9 579 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 FBXL13Q8NEE6 735 aa7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 CD93Q9NPY3 652 aa7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 CISHQ9NSE2 258 aa7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 RAB20Q9NX57 234 aa7.3□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.3□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 GFRA2O00451 464 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 RALAP11233 206 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 ENGP17813 658 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 DPP6P42658 865 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 DGKGP49619 791 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 MFAP3P55082 362 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 LMAN2Q12907 356 aa7.29□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 CBWD3Q5JTY5 395 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 SLC36A4Q6YBV0 504 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 TADA2BQ86TJ2 420 aa7.29□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 TTC39CQ8N584 583 aa7.29□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.29□□□□□ -1.24
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CTXN3-201ENST00000379445 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 MRGPRX1Q96LB2 322 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 PLK2Q9NYY3 685 aa7.29□□□□□ -1.24
CTXN3-201ENST00000379445 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa7.29□□□□□ -1.24
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