RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 SIK3Q9Y2K2 1263 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 HSF2BPO75031 334 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 GRAP2O75791 330 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ERBB2P04626 1255 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 CFIP05156 583 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 DLDP09622 509 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 TACR2P21452 398 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 TPMTP51580 245 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 MTA1Q13330 715 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 PTPN20Q4JDL3 420 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 FSCBQ5H9T9 825 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 CHSY1Q86X52 802 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 LGI2Q8N0V4 545 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 MSANTD4Q8NCY6 345 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 BTN2A3PQ96KV6 586 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 HSD3B7Q9H2F3 369 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.497e-7■■■■□ 25.5
FAAP20-201ENST00000378543 SLC6A14Q9UN76 642 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 PCDH15Q96QU1 1955 aa24.34■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 KCNK5O95279 499 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 MAPK8P45983 427 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 CDK17Q00537 523 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 UBXN1Q04323 297 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 NUMA1Q14980 2115 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 UAP1L1Q3KQV9 507 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 OLFML1Q6UWY5 402 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 RGL4Q8IZJ4 473 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 CEP76Q8TAP6 659 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 TTC17Q96AE7 1141 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 SPAG5Q96R06 1193 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 GPR174Q9BXC1 333 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 SYNCQ9H7C4 482 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 DDIT4Q9NX09 232 aa24.33■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 IGLV3-19P01714 112 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 SERPINF2P08697 491 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 ACADMP11310 421 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 MAOBP27338 520 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 OXTRP30559 389 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 SCNN1AP37088 669 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 CSKP41240 450 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF165P49910 485 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 JAM2P57087 298 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 CDH18Q13634 790 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 SYCP1Q15431 976 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 NEK11Q8NG66 645 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 FOXJ1Q92949 421 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 MYO19Q96H55 970 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 MTG2Q9H4K7 406 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 CAPN10Q9HC96 672 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 PRSS16Q9NQE7 514 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 COX16Q9P0S2 106 aa24.32■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 SLC2A3P11169 496 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 SOX5P35711 763 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 STAT1P42224 750 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 GABRB2P47870 512 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 SLC6A3Q01959 620 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 SYCP2LQ5T4T6 812 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 SLC26A9Q7LBE3 791 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 EPS8L1Q8TE68 723 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 FUCA2Q9BTY2 467 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 RRN3Q9NYV6 651 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.31■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 H0Y626 953 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 GIPC1O14908 333 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 C7P10643 843 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 PITRM1Q5JRX3 1037 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 RABEPKQ7Z6M1 372 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 MRGPRX3Q96LB0 322 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 NUP58Q9BVL2 599 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 SUN2Q9UH99 717 aa24.3■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 FAM170AA1A519 330 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 F5H5T6 163 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 DAB1O75553 588 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 ASLP04424 464 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 CCR1P32246 355 aa24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 RPS14P62263 151 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
FAAP20-201ENST00000378543 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms