RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376854.5

C9orf40-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf40, Length 2,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40-201ENST00000376854 POLBP06746 335 aa25.96■■□□□ 1.75
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C9orf40-201ENST00000376854 GRK2P25098 689 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf40-201ENST00000376854 MLH1P40692 756 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf40-201ENST00000376854 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
C9orf40-201ENST00000376854 ADIGQ0VDE8 80 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf40-201ENST00000376854 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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C9orf40-201ENST00000376854 ZNF567Q8N184 647 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf40-201ENST00000376854 CDHR5Q9HBB8 845 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf40-201ENST00000376854 PNPOQ9NVS9 261 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf40-201ENST00000376854 TMEM216Q9P0N5 145 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf40-201ENST00000376854 PLXNB2O15031 1838 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf40-201ENST00000376854 A0A088AWK7 358 aa25.96■■□□□ 1.75
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C9orf40-201ENST00000376854 SIN3BO75182 1162 aa25.96■■□□□ 1.75
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C9orf40-201ENST00000376854 SLC25A3Q00325 362 aa25.96■■□□□ 1.75
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C9orf40-201ENST00000376854 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf40-201ENST00000376854 ATG14Q6ZNE5 492 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf40-201ENST00000376854 PIGZQ86VD9 579 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf40-201ENST00000376854 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
C9orf40-201ENST00000376854 SLC25A41Q8N5S1 370 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf40-201ENST00000376854 PRDM12Q9H4Q4 367 aa25.96■■□□□ 1.75
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C9orf40-201ENST00000376854 COPG2Q9UBF2 871 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf40-201ENST00000376854 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa25.96■■□□□ 1.75
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C9orf40-201ENST00000376854 IDH3AP50213 366 aa25.95■■□□□ 1.74
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C9orf40-201ENST00000376854 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 POU5F2Q8N7G0 328 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 APPL2Q8NEU8 664 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 TTC1Q99614 292 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 NDE1Q9NXR1 346 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 SCOCQ9UIL1 159 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 DAB1O75553 588 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 CD4P01730 458 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 GARSP41250 739 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 CERS2Q96G23 380 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 OSMRQ99650 979 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 FAM96AQ9H5X1 160 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 DNAJC28Q9NX36 388 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 ADCY6O43306 1168 aa25.94■■□□□ 1.74
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C9orf40-201ENST00000376854 GMPRP36959 345 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 CCNA1P78396 465 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 RSPH3Q86UC2 560 aa25.94■■□□□ 1.74
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C9orf40-201ENST00000376854 GDAP2Q9NXN4 497 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 KLK14Q9P0G3 267 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 DNAJB4Q9UDY4 337 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 E2F8A0AVK6 867 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 ARHGAP42A6NI28 874 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 GPR32O75388 356 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 BAG2O95816 211 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 MMP3P08254 477 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 ARRB2P32121 409 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 COPAP53621 1224 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 SPANXN3Q5MJ09 141 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 PID1Q7Z2X4 250 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 GSTCDQ8NEC7 633 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 SNX15Q9NRS6 342 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 IGSF9Q9P2J2 1179 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.749e-6■■■■■ 68.9
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C9orf40-201ENST00000376854 MX2P20592 715 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 OLIG2Q13516 323 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 GRTP1Q5TC63 336 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 PGLYRP2Q96PD5 576 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 DNAI2Q9GZS0 605 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 PPM1HQ9ULR3 514 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 M0QYT0 321 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 NME3Q13232 169 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 TMCO4Q5TGY1 634 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 CMC1Q7Z7K0 106 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 TP53INP2Q8IXH6 220 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 OR52K1Q8NGK4 314 aa25.92■■□□□ 1.74
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C9orf40-201ENST00000376854 TNIP3Q96KP6 325 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF358Q9NW07 568 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 FKBP6O75344 327 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 CPA3P15088 417 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 NOS2P35228 1153 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 ITGA9Q13797 1035 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf40-201ENST00000376854 IZUMO2Q6UXV1 221 aa25.92■■□□□ 1.74
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