RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363574.1

RNU6-1339P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1339, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1339P, Length 91 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CD180Q99467 661 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MPHOSPH8Q99549 860 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 USP29Q9HBJ7 922 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ARHGEF3Q9NR81 526 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HAUS2Q9NVX0 235 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KLQ9UEF7 1012 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 VPS28Q9UK41 221 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SARDHQ9UL12 918 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TEX22C9J3V5 150 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MPPED1O15442 326 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PEX1O43933 1283 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C1RP00736 705 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 URODP06132 367 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NR2F6P10588 404 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PRPH2P23942 346 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FPR3P25089 353 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HNF1BP35680 557 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FOLR3P41439 243 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AGTR2P50052 363 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GOLGA8FQ08AF8 430 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GAB1Q13480 694 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NAA25Q14CX7 972 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TIGD2Q4W5G0 525 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SH2D4BQ5SQS7 431 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DENND2CQ68D51 928 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TMEM88Q6PEY1 159 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MTHFD1LQ6UB35 978 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MON1AQ86VX9 555 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SCN4BQ8IWT1 228 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LAS2Q8IYD9 372 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TFAP2BQ92481 460 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SH3KBP1Q96B97 665 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KAZALD1Q96I82 304 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 Q96MF0 132 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EYA3Q99504 573 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HTATIP2Q9BUP3 242 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HDHD5Q9BXW7 423 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PARD6AQ9NPB6 346 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DUSP22Q9NRW4 184 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DLL3Q9NYJ7 618 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HCN3Q9P1Z3 774 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FZD4Q9ULV1 537 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FZD1Q9UP38 647 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DBX1A6NMT0 343 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TGFB1I1O43294 461 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PLOD3O60568 738 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ENGP17813 658 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CYP2C18P33260 490 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ARL3P36405 182 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ARHGAP8P85298 464 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 B4GALNT1Q00973 533 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MAMLD1Q13495 774 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CUL4AQ13619 759 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KIRREL2Q6UWL6 708 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RHOUQ7L0Q8 258 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C1orf210Q8IVY1 113 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SFTPA1Q8IWL2 248 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ABHD11Q8NFV4 315 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TNIP2Q8NFZ5 429 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ETNPPLQ8TBG4 499 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EXTL1Q92935 676 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KIF1BPQ96EK5 621 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FSD1LQ9BXM9 530 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SERTAD4Q9NUC0 356 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KCND2Q9NZV8 630 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HDAC6Q9UBN7 1215 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PIPSLA2A3N6 862 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 H0YIZ8 118 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 AP3D1O14617 1153 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ORC4O43929 436 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms