RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 SRGAP2O75044 1071 aa27.62■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 DCNP07585 359 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 AVPR2P30518 371 aa27.62■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 BOLA3Q53S33 107 aa27.62■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 MFN1Q8IWA4 741 aa27.62■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF683Q8IZ20 524 aa27.62■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 CARNMT1Q8N4J0 409 aa27.62■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 IER2Q9BTL4 223 aa27.62■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 LRFN3Q9BTN0 628 aa27.62■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 RETREG1Q9H6L5 497 aa27.62■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 CLEC4EQ9ULY5 219 aa27.62■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 USP18Q9UMW8 372 aa27.62■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa27.61■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1B0GVM2 712 aa27.61■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 TCAF2A6NFQ2 919 aa27.61■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 K7EQS6 105 aa27.61■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 CLDN11O75508 207 aa27.61■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 PROSCO94903 275 aa27.61■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 GGCXP38435 758 aa27.61■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 CDH4P55283 916 aa27.61■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 CDH18Q13634 790 aa27.61■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa27.61■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 SNX10Q9Y5X0 201 aa27.61■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM24O15164 1050 aa27.6■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP6O43182 974 aa27.6■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 TIMM44O43615 452 aa27.6■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 L1CAMP32004 1257 aa27.6■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 OXCT1P55809 520 aa27.6■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 E2F5Q15329 346 aa27.6■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 HADHQ16836 314 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 CHST9Q7L1S5 443 aa27.6■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 KCNV2Q8TDN2 545 aa27.6■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 MAN1A1P33908 653 aa27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 NOP2P46087 812 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 HADHBP55084 474 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 MESP2Q0VG99 397 aa27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 MESDQ14696 234 aa27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM105Q8N8V8 129 aa27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R9BQ96SB3 815 aa27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 ZYG11BQ9C0D3 744 aa27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 CHRDQ9H2X0 955 aa27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 STARD13Q9Y3M8 1113 aa27.59■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 ATG13O75143 517 aa27.58■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 HLA-FP30511 346 aa27.58■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 VAV2P52735 878 aa27.58■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 NUBP1P53384 320 aa27.58■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 SLC12A1Q13621 1099 aa27.58■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA1328Q86T90 577 aa27.58■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 ACRBPQ8NEB7 543 aa27.58■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 ABCB8Q9NUT2 735 aa27.58■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 GGA2Q9UJY4 613 aa27.58■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 AP4E1Q9UPM8 1137 aa27.58■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 BTNL10A8MVZ5 291 aa27.57■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 HTR7P34969 479 aa27.57■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 SSR1P43307 286 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 MANEALQ5VSG8 457 aa27.57■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 MAMSTRQ6ZN01 415 aa27.57■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 AHI1Q8N157 1196 aa27.57■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 UCMAQ8WVF2 138 aa27.57■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D31Q96DN5 1066 aa27.57■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 PEBP4Q96S96 227 aa27.57■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 EPAS1Q99814 870 aa27.57■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 MAGEB5Q9BZ81 275 aa27.57■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 KMT2EQ8IZD2 1858 aa27.56■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa27.56■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 FAM72CH0Y354 149 aa27.56■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 PJA2O43164 708 aa27.56■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 RNF40O75150 1001 aa27.56■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 LRIG2O94898 1065 aa27.56■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 MOCS3O95396 460 aa27.56■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 DMC1Q14565 340 aa27.56■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 GEN1Q17RS7 908 aa27.56■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 FAM72AQ5TYM5 149 aa27.56■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 FAM72DQ6L9T8 149 aa27.56■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 FAM72BQ86X60 149 aa27.56■■■□□ 2
CRIP1-201ENST00000330233 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms