RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 NPWQ8N729 165 aa22.33■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 C10orf82Q8WW14 230 aa22.33■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CDKL2Q92772 493 aa22.33■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 MKS1Q9NXB0 559 aa22.33■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 INPPL1O15357 1258 aa22.33■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 DCTN3O75935 186 aa22.33■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.16
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SPHK1-201ENST00000323374 EPHB2P29323 1055 aa22.33■■□□□ 1.16
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SPHK1-201ENST00000323374 CAP1Q01518 475 aa22.33■■□□□ 1.16
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SPHK1-201ENST00000323374 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.33■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 HDAC11Q96DB2 347 aa22.33■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.33■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 RNF186Q9NXI6 227 aa22.33■■□□□ 1.16
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SPHK1-201ENST00000323374 LRIG2O94898 1065 aa22.32■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 SERPINB4P48594 390 aa22.32■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 GALNT2Q10471 571 aa22.32■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 MROH9Q5TGP6 573 aa22.32■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa22.32■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF398Q8TD17 642 aa22.32■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 PTPRN2Q92932 1015 aa22.32■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.32■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 PLLPQ9Y342 182 aa22.32■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.32■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.31■■□□□ 1.16
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SPHK1-201ENST00000323374 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.31■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.31■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.31■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 ACLYP53396 1101 aa22.31■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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SPHK1-201ENST00000323374 CRYMQ14894 314 aa22.31■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 TIFABQ6ZNK6 161 aa22.31■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.31■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 OSBPL2Q9H1P3 480 aa22.31■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 NPHS2Q9NP85 383 aa22.31■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 RGS18Q9NS28 235 aa22.31■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 SYBUQ9NX95 663 aa22.31■■□□□ 1.16
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SPHK1-201ENST00000323374 CHKBQ9Y259 395 aa22.31■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.31■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 HMX2A2RU54 273 aa22.3■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 F8W810 466 aa22.3■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 CYP2C18P33260 490 aa22.3■■□□□ 1.16
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SPHK1-201ENST00000323374 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.3■■□□□ 1.16
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SPHK1-201ENST00000323374 MYLK2Q9H1R3 596 aa22.3■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 AP2A1O95782 977 aa22.3■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 IGLV3-25P01717 112 aa22.3■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 GRIK1P39086 918 aa22.3■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 UNC5BQ8IZJ1 945 aa22.3■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 KLHL29Q96CT2 875 aa22.3■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 ERP27Q96DN0 273 aa22.3■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 VAT1Q99536 393 aa22.3■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.3■■□□□ 1.16
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SPHK1-201ENST00000323374 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 EOMESO95936 686 aa22.29■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 POLBP06746 335 aa22.29■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 CKBP12277 381 aa22.29■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 BGNP21810 368 aa22.29■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 SLC5A3P53794 718 aa22.29■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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SPHK1-201ENST00000323374 KLF11O14901 512 aa22.28■■□□□ 1.16
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SPHK1-201ENST00000323374 NQO1P15559 274 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
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SPHK1-201ENST00000323374 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.28■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.28■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM42Q8IWZ5 723 aa22.28■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 OR52K1Q8NGK4 314 aa22.28■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22.28■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.28■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 GBA3Q9H227 469 aa22.28■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 TXLNGQ9NUQ3 528 aa22.28■■□□□ 1.16
SPHK1-201ENST00000323374 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa22.28■■□□□ 1.16
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