RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
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CCDC71L-201ENST00000315965 DEFB123Q8N688 67 aa24.76■■□□□ 1.55
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CCDC71L-201ENST00000315965 TBC1D14Q9P2M4 693 aa24.74■■□□□ 1.55
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CCDC71L-201ENST00000315965 FAM118BQ9BPY3 351 aa24.72■■□□□ 1.55
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CCDC71L-201ENST00000315965 VCPP55072 806 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CCDC71L-201ENST00000315965 CDH4P55283 916 aa24.71■■□□□ 1.55
CCDC71L-201ENST00000315965 RPS24P62847 133 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CCDC71L-201ENST00000315965 TUBB4BP68371 445 aa24.71■■□□□ 1.55
CCDC71L-201ENST00000315965 SNX1Q13596 522 aa24.71■■□□□ 1.55
CCDC71L-201ENST00000315965 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CCDC71L-201ENST00000315965 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CCDC71L-201ENST00000315965 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa24.71■■□□□ 1.55
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