RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309576.10

PPARG-202, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene PPARG, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-202ENST00000309576 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.52■□□□□ 0.88
PPARG-202ENST00000309576 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.52■□□□□ 0.88
PPARG-202ENST00000309576 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PPARG-202ENST00000309576 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PPARG-202ENST00000309576 RFX6Q8HWS3 928 aa20.52■□□□□ 0.88
PPARG-202ENST00000309576 LGI2Q8N0V4 545 aa20.52■□□□□ 0.88
PPARG-202ENST00000309576 CPXM2Q8N436 756 aa20.52■□□□□ 0.88
PPARG-202ENST00000309576 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.52■□□□□ 0.88
PPARG-202ENST00000309576 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PPARG-202ENST00000309576 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PPARG-202ENST00000309576 OBP2AQ9NY56 170 aa20.52■□□□□ 0.88
PPARG-202ENST00000309576 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PPARG-202ENST00000309576 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 DYNLT1P63172 113 aa20.52■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 TFDP2Q14188 446 aa20.52■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 LRRC31Q6UY01 552 aa20.52■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.52■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 KLC2Q9H0B6 622 aa20.52■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.52■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.52■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 VCPP55072 806 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 CCDC181Q5TID7 509 aa20.51■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.51■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.51■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 EPS15L1Q9UBC2 864 aa20.51■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 WASH4PA8MWX3 477 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 APOL1O14791 398 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 DAPK3O43293 454 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 TSPAN3O60637 253 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 CHKAP35790 457 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 PAFAH1B1P43034 410 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 NPWQ8N729 165 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 PRELID2Q8N945 189 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 FGF14Q92915 247 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 STIM2Q9P246 746 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 APOC2P02655 101 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 RHOQP17081 205 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 GBE1Q04446 702 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 PARM1Q6UWI2 310 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 VITQ6UXI7 678 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 NPNTQ6UXI9 565 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 ASIC4Q96FT7 647 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.5■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 KRIT1O00522 736 aa20.49■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.49■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.49■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 RNF43Q68DV7 783 aa20.49■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.49■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.49■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 TGM2P21980 687 aa20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 RABGAP1LQ5R372 815 aa20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 ACTL9Q8TC94 416 aa20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 E2F7Q96AV8 911 aa20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 HAUS1Q96CS2 278 aa20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 OTUB2Q96DC9 234 aa20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 DTLQ9NZJ0 730 aa20.48■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 MFSD11O43934 449 aa20.47■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 CYP1B1Q16678 543 aa20.47■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 C1orf228Q6PIY5 440 aa20.47■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 TMEM25Q86YD3 366 aa20.47■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.47■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 NETO2Q8NC67 525 aa20.47■□□□□ 0.87
PPARG-202ENST00000309576 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms