RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 TTLL13PA6NNM8 815 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PTGES3LE9PB15 166 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP2R1BP30154 601 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 STARD3Q14849 445 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 KATNAL2Q8IYT4 538 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A087X1B8 175 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 RXRGP48443 463 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PKNOX1P55347 436 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PGM5Q15124 567 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 KCTD21Q4G0X4 260 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 C11orf88Q6PI97 169 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXL16Q8N461 479 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SNTG2Q9NY99 539 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 E9PCH4 1651 aa24.64■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP2A7P20853 494 aa24.64■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.64■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 FGFR2P21802 821 aa24.64■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC26A2P50443 739 aa24.64■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 EXOC3L1Q86VI1 746 aa24.64■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM45AQ8TCE6 357 aa24.64■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 OMA1Q96E52 524 aa24.64■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ADPRHL2Q9NX46 363 aa24.64■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TPP1O14773 563 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SLITRK3O94933 977 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ACTRT2Q8TDY3 377 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 DLG3Q92796 817 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 FANCEQ9HB96 536 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 POLLQ9UGP5 575 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SHBGP04278 402 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINF2P08697 491 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ALDH9A1P49189 494 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 BACE1P56817 501 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ST3GAL1Q11201 340 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CNGA2Q16280 664 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6V1HQ9UI12 483 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP4AP20648 1035 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 FGFR3P22607 806 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 FLT3P36888 993 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL14P50914 215 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 KCND1Q9NSA2 647 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 MSH3P20585 1137 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TKTP29401 623 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 PHKG1Q16816 387 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC45A4Q5BKX6 768 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 NEK10Q6ZWH5 1172 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 GINS4Q9BRT9 223 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TAS2R13Q9NYV9 303 aa24.63■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CLTBP09497 229 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CBWD3Q5JTY5 395 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CBWD5Q5RIA9 395 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKS6Q68DC2 871 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 AADACL2Q6P093 401 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ENKURQ8TC29 256 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF446Q9NWS9 450 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL28Q9NXS3 571 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 GAKO14976 1311 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 GJB6O95452 261 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 APOC2P02655 101 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 VIL1P09327 827 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ISLR2Q6UXK2 745 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 MILR1Q7Z6M3 343 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SYT15Q9BQS2 421 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGEF3Q9NR81 526 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CDC25CP30307 473 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CSNK2BP67870 215 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF180Q86T96 592 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 ENOPH1Q9UHY7 261 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP152O94986 1710 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 BFSP2Q13515 415 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa24.62■■□□□ 1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms