RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 TAF10Q12962 218 aa23.39■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL38Q2WGJ6 581 aa23.39■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MANEALQ5VSG8 457 aa23.39■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MSANTD2Q6P1R3 559 aa23.39■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 NLRP14Q86W24 1093 aa23.39■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 GIPC2Q8TF65 315 aa23.39■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 PLAC1Q9HBJ0 212 aa23.39■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 HS3ST4Q9Y661 456 aa23.39■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 WDR27A2RRH5 827 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 NDUFAB1O14561 156 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MX2P20592 715 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 EFEMP1Q12805 493 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MPP2Q14168 576 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 PARP6Q2NL67 630 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 RASIP1Q5U651 963 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 TRABD2AQ86V40 505 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MGARPQ8TDB4 240 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 SLC39A13Q96H72 371 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 PAFAH2Q99487 392 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 TLR6Q9Y2C9 796 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 GMNCA6NCL1 334 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 CLTBP09497 229 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 SMARCB1Q12824 385 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC14Q15048 493 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 C14orf80Q86SX3 495 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA17Q96L03 361 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 SIGLEC10Q96LC7 697 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 DHRS4Q9BTZ2 278 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 FAM107BQ9H098 131 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 PPCSQ9HAB8 311 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 KIF9Q9HAQ2 790 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 FETUBQ9UGM5 382 aa23.38■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 C2CD2LO14523 706 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 KRT15P19012 456 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 ITGB8P26012 769 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 HOXC13P31276 330 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 RASA2Q15283 850 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 USP41Q3LFD5 358 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 IGSF21Q96ID5 467 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 CCT8L2Q96SF2 557 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 IGSF9Q9P2J2 1179 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MTRRQ9UBK8 725 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 ACTL7BQ9Y614 415 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 ATF6P18850 670 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 CCT5P48643 541 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 TBX4P57082 545 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB17Q13105 803 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD42Q8N9B4 389 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D31Q96DN5 1066 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 CYTH2Q99418 400 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 BRD8Q9H0E9 1235 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 NDFIP2Q9NV92 336 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 CLIC5Q9NZA1 410 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa23.37■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 E9PAM4 449 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 CPP00450 1065 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 OR1D2P34982 312 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 PSMD5Q16401 504 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 PIK3R6Q5UE93 754 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 SLC8B1Q6J4K2 584 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRD1Q6QNK2 874 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MIB1Q86YT6 1006 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC39Q96DD0 335 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
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VSTM4-201ENST00000298454 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MLXIPLQ9NP71 852 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 TTLL3Q9Y4R7 772 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 COL4A6Q14031 1691 aa23.36■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 DFFAO00273 331 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 SPAG6O75602 509 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MSH2P43246 934 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 IFNAR2P48551 515 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 TUBP50607 506 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 SARNPP82979 210 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 CDK16Q00536 496 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 NR1H3Q13133 447 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 DCAKDQ8WVC6 231 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 TOP1MTQ969P6 601 aa23.35■■□□□ 1.33
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