RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287820.10

PPARG-201, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPARG, Length 1,850 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-201ENST00000287820 SULT1E1P49888 294 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 ZBED6P86452 979 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 KLHL30Q0D2K2 578 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 ZNF234Q14588 700 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 HGSNATQ68CP4 663 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 KIAA1211LQ6NV74 962 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 CHST9Q7L1S5 443 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 C14orf80Q86SX3 495 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 CHSY1Q86X52 802 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 MFN1Q8IWA4 741 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 ZNF683Q8IZ20 524 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 IGSF8Q969P0 613 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 HAPLN3Q96S86 360 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 SIK2Q9H0K1 926 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 GGA2Q9UJY4 613 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 PLA2G4CQ9UP65 541 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 HS3ST4Q9Y661 456 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 CKAP5Q14008 2032 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 NUP205Q92621 2012 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 KNL1Q8NG31 2342 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 RTN2O75298 545 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 GJB6O95452 261 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 DLDP09622 509 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 C7P10643 843 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 HOXB2P14652 356 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 GABRG2P18507 467 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 IL12RB1P42701 662 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 PLK1P53350 603 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 ATP11AP98196 1134 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 LMAN2Q12907 356 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 PTPRNQ16849 979 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 RAB6CQ53S08 254 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 MBLAC2Q68D91 279 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 ANO7Q6IWH7 933 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 STRADAQ7RTN6 431 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 AHI1Q8N157 1196 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 CARNMT1Q8N4J0 409 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 SORCS1Q8WY21 1168 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 RUBCNQ92622 972 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 SELENOOQ9BVL4 669 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 CIPCQ9C0C6 399 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 RAB6CQ9H0N0 254 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 ISCUQ9H1K1 167 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 TMEM245Q9H330 911 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 VANGL2Q9ULK5 521 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.7□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 A0A1B0GVM2 712 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 H0Y626 953 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 GYPCP04921 128 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 TPM3P06753 285 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 RRM1P23921 792 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 SDC4P31431 198 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 CASP14P31944 242 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 ADRA1BP35368 520 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 MAMLD1Q13495 774 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 SLC12A1Q13621 1099 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 DRC7Q8IY82 874 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 DCLK2Q8N568 766 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 RNF214Q8ND24 703 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 HMGB4Q8WW32 186 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 ALG14Q96F25 216 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.69□□□□□ -1.02
PPARG-201ENST00000287820 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms