RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266254.11

TTLL1-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL1, Length 1,645 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-201ENST00000266254 PNKPQ96T60 521 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 CORO1BQ9BR76 489 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 SIK2Q9H0K1 926 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 C2orf78A6NCI8 922 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 HMBSP08397 361 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 VCPP55072 806 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 NOMO1Q15155 1222 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 C1orf228Q6PIY5 440 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 JAMLQ86YT9 394 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 SLC35B2Q8TB61 432 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 PLD4Q96BZ4 506 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 CCDC114Q96M63 670 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 MYADMQ96S97 322 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 RAB17Q9H0T7 212 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 DNPEPQ9ULA0 475 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 SNX10Q9Y5X0 201 aa23.41■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 MCF2LO15068 1137 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 LRIG2O94898 1065 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 GAS8O95995 478 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 PTPN2P17706 415 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 NR2C2P49116 596 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 WDR93Q6P2C0 686 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 NPNTQ6UXI9 565 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 GAREM2Q75VX8 874 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 EDAQ92838 391 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 TRPC7Q9HCX4 862 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 RAB21Q9UL25 225 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 SORCS3Q9UPU3 1222 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 ZNF148Q9UQR1 794 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 HS3ST4Q9Y661 456 aa23.4■■□□□ 1.34
TTLL1-201ENST00000266254 ITGAVP06756 1048 aa23.39■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 RHOP08100 348 aa23.39■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 MYL4P12829 197 aa23.39■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 EPHA5P54756 1037 aa23.39■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 ZXDAP98168 799 aa23.39■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 GUCY2DQ02846 1103 aa23.39■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 OASLQ15646 514 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 LEMD2Q8NC56 503 aa23.39■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 RNF38Q9H0F5 515 aa23.39■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 EPS15L1Q9UBC2 864 aa23.39■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 HEY1Q9Y5J3 304 aa23.39■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 DOCK4Q8N1I0 1966 aa23.39■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 PFKLP17858 780 aa23.38■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 ERCC2P18074 760 aa23.38■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 EPHB2P29323 1055 aa23.38■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 IFT20Q8IY31 132 aa23.38■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 TBC1D31Q96DN5 1066 aa23.38■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 ATXN3LQ9H3M9 355 aa23.38■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 C11orf16Q9NQ32 467 aa23.38■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 ETNK2Q9NVF9 386 aa23.38■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 HELZP42694 1942 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 DCLK1O15075 740 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 GPR37L1O60883 481 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 OLFM2O95897 454 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 HOXC13P31276 330 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 GGCXP38435 758 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 HARS2P49590 506 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 PPP1R7Q15435 360 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 MS4A13Q5J8X5 152 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 PIK3R6Q5UE93 754 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 MANEALQ5VSG8 457 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 TXNDC8Q6A555 127 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 ITFG1Q8TB96 612 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 TRIM51Q9BSJ1 452 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 EPB41L5Q9HCM4 733 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 CDH7Q9ULB5 785 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 DOCK6Q96HP0 2047 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 E9PAM4 449 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 RBP3P10745 1247 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 LAMP2P13473 410 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 HDCP19113 662 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 CYP4F8P98187 520 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 GSTA5Q7RTV2 222 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 FGF13Q92913 245 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 ERP44Q9BS26 406 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 KCNK12Q9HB15 430 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 GDF3Q9NR23 364 aa23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 A0A1W2PRU2 124 aa23.36■■□□□ 1.33
TTLL1-201ENST00000266254 SLC11A2P49281 568 aa23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms