RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 POU2F3Q9UKI9 436 aa22.48■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 PPME1Q9Y570 386 aa22.48■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa22.48■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 H3BNH8 94 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 CAPNS1P04632 268 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 ATP6V0D1P61421 351 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 WDR78Q5VTH9 848 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 XKR5Q6UX68 686 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 CADM3Q8N126 398 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 SACM1LQ9NTJ5 587 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 SUN5Q8TC36 379 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 MZB1Q8WU39 189 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 NLRP7Q8WX94 980 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 ATG4AQ8WYN0 398 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 ATP2A3Q93084 1043 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 MROQ9BYG7 248 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 MYRFQ9Y2G1 1151 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 CENPFP49454 3210 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 PTK7Q13308 1070 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 EPC2Q52LR7 807 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 TMEM143Q96AN5 459 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 DOK1Q99704 481 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 CNTN3Q9P232 1028 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 RNF11Q9Y3C5 154 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 FAM170AA1A519 330 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 CTBSQ01459 385 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 CENPCQ03188 943 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 EMC2Q15006 297 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 FBXW8Q8N3Y1 598 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-201ENST00000265340 AOC2O75106 756 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 ATE1O95260 518 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 IFITM2Q01629 132 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 LY6KQ17RY6 165 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 PORCNQ9H237 461 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 RIMS3Q9UJD0 308 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 ARIH2O95376 493 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 SLC1A1P43005 524 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 ADAM17P78536 824 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 LSMEM2Q8N112 164 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 MINDY2Q8NBR6 621 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 SPATA17Q96L03 361 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 TRIM64BA6NI03 449 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 J3QRK9 145 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 PRKACBP22694 351 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 APLP1P51693 650 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 COPAP53621 1224 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 TERB1Q8NA31 727 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 KAT5Q92993 513 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 FBXL8Q96CD0 374 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 FAM84AQ96KN4 292 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 ADAM33Q9BZ11 813 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 ACP6Q9NPH0 428 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 I3L4J1 428 aa22.43■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 LPXNO60711 386 aa22.43■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 ALOX5P09917 674 aa22.43■■□□□ 1.18
PITX1-201ENST00000265340 ITGADQ13349 1161 aa22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms